RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 PIP4K2BP78356 416 aa13.36□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 GOLGA3Q08378 1498 aa13.36□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 ATP10BO94823 1461 aa13.32□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.32□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.29□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.28□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 ATP10AO60312 1499 aa13.27□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 HECW1Q76N89 1606 aa13.26□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.26□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.25□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 TOM1O60784 492 aa13.25□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.23□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 C3P01024 1663 aa13.21□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.2□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 PLA2R1Q13018 1463 aa13.19□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 PKD2Q13563 968 aa13.18□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 POTEAQ6S8J7 498 aa13.17□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 CPS1P31327 1500 aa13.17□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 NPATQ14207 1427 aa13.15□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 PTPRKQ15262 1439 aa13.15□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.15□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SNORD46-201ENST00000364043 REREQ9P2R6 1566 aa13.14□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 P3H3Q8IVL6 736 aa13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 AGLP35573 1532 aa13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.12□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 ALKQ9UM73 1620 aa13.09□□□□□ -0.31
SNORD46-201ENST00000364043 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.08□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.08□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.07□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.07□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.06□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 KDM5CP41229 1560 aa13.06□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 PLCH2O75038 1416 aa13.05□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 MROH2AA6NES4 1674 aa13.05□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.04□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.04□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 ABCA6Q8N139 1617 aa12.99□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 SAMD9Q5K651 1589 aa12.99□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.99□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 AFAP1Q8N556 730 aa12.99□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.98□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 ZMYM3Q14202 1370 aa12.98□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.97□□□□□ -0.33
SNORD46-201ENST00000364043 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.95□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.93□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.93□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 SYNMO15061 1565 aa12.92□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 PRXQ9BXM0 1461 aa12.91□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.9□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 TRIM52Q96A61 297 aa12.9□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.87□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 MED14O60244 1454 aa12.86□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.85□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.84□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.84□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.84□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 DEPDC5O75140 1603 aa12.83□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 ABCC1P33527 1531 aa12.81□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.8□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 KIF14Q15058 1648 aa12.79□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 IQGAP1P46940 1657 aa12.79□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.77□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 FOXD1Q16676 465 aa12.77□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 PLXNC1O60486 1568 aa12.77□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 TNRQ92752 1358 aa12.76□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 GGT6Q6P531 493 aa12.75□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 JCADQ9P266 1359 aa12.74□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 RXRBP28702 533 aa12.74□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.73□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms