RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 PIP4K2BP78356 416 aa13.36□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 GOLGA3Q08378 1498 aa13.36□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SNORD46-201ENST00000364043 ATP10BO94823 1461 aa13.32□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.32□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.29□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.28□□□□□ -0.28
SNORD46-201ENST00000364043 ATP10AO60312 1499 aa13.27□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 HECW1Q76N89 1606 aa13.26□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.26□□□□□ -0.29
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SNORD46-201ENST00000364043 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
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SNORD46-201ENST00000364043 C3P01024 1663 aa13.21□□□□□ -0.29
SNORD46-201ENST00000364043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.2□□□□□ -0.3
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SNORD46-201ENST00000364043 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.07□□□□□ -0.32
SNORD46-201ENST00000364043 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.06□□□□□ -0.32
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SNORD46-201ENST00000364043 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.93□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.93□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 SYNMO15061 1565 aa12.92□□□□□ -0.34
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SNORD46-201ENST00000364043 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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SNORD46-201ENST00000364043 TRIM52Q96A61 297 aa12.9□□□□□ -0.34
SNORD46-201ENST00000364043 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.87□□□□□ -0.35
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SNORD46-201ENST00000364043 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.84□□□□□ -0.35
SNORD46-201ENST00000364043 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.84□□□□□ -0.35
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SNORD46-201ENST00000364043 DEPDC5O75140 1603 aa12.83□□□□□ -0.36
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SNORD46-201ENST00000364043 ABCC1P33527 1531 aa12.81□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.8□□□□□ -0.36
SNORD46-201ENST00000364043 KIF14Q15058 1648 aa12.79□□□□□ -0.36
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SNORD46-201ENST00000364043 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
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SNORD46-201ENST00000364043 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.77□□□□□ -0.36
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SNORD46-201ENST00000364043 PLXNC1O60486 1568 aa12.77□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 TNRQ92752 1358 aa12.76□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 GGT6Q6P531 493 aa12.75□□□□□ -0.37
SNORD46-201ENST00000364043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
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SNORD46-201ENST00000364043 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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