RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362076.8

C1orf43-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf43, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-202ENST00000362076 NAIPQ13075 1403 aa23.58■■□□□ 1.36
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C1orf43-202ENST00000362076 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.54■■□□□ 1.36
C1orf43-202ENST00000362076 PREX2Q70Z35 1606 aa23.53■■□□□ 1.36
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C1orf43-202ENST00000362076 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.49■■□□□ 1.35
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C1orf43-202ENST00000362076 TSPY10P0CW01 314 aa23.4■■□□□ 1.34
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C1orf43-202ENST00000362076 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.37■■□□□ 1.33
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C1orf43-202ENST00000362076 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.3■■□□□ 1.32
C1orf43-202ENST00000362076 KDM6BO15054 1643 aa23.29■■□□□ 1.32
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C1orf43-202ENST00000362076 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.12■■□□□ 1.29
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C1orf43-202ENST00000362076 ADGRL1O94910 1474 aa23.11■■□□□ 1.29
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C1orf43-202ENST00000362076 NUP155O75694 1391 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf43-202ENST00000362076 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.06■■□□□ 1.28
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C1orf43-202ENST00000362076 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.92■■□□□ 1.26
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C1orf43-202ENST00000362076 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.9■■□□□ 1.26
C1orf43-202ENST00000362076 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.9■■□□□ 1.26
C1orf43-202ENST00000362076 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
C1orf43-202ENST00000362076 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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C1orf43-202ENST00000362076 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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