RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP10BO94823 1461 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM6BO15054 1643 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNH8Q96L42 1107 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 TONSLQ96HA7 1378 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1-201ENST00000357436 MIA2Q96PC5 1412 aa26.64■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC5O15440 1437 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA8O94911 1581 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DAPK1P53355 1430 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 AKNAQ7Z591 1439 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1-201ENST00000357436 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1-201ENST00000357436 MYT1Q01538 1121 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1-201ENST00000357436 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP1-201ENST00000357436 CCER2I3L3R5 266 aa26.45■■□□□ 1.83
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP1-201ENST00000357436 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1-201ENST00000357436 ANP32CO43423 234 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1-201ENST00000357436 SHROOM2Q13796 1616 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 NCOA1Q15788 1441 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 ROCK1Q13464 1354 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPY4P0CV99 314 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPY10P0CW01 314 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1-201ENST00000357436 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.33■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC2Q92887 1545 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PKD2Q13563 968 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1-201ENST00000357436 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.793e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP155O75694 1391 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 OSCARQ8IYS5 282 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF15Q9NS87 1388 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SH3BP1-201ENST00000357436 MBD5Q9P267 1494 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.789e-9■■■■□ 19.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PZPP20742 1482 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 AFAP1Q8N556 730 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRL2O95490 1459 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP8Q14318 412 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 PREX2Q70Z35 1606 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC7Q96M83 1385 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCH2O75038 1416 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 BCANQ96GW7 911 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NEFLP07196 543 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RGL3Q3MIN7 710 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 ASXL2Q76L83 1435 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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