RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.37■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 MORC1Q86VD1 984 aa20.36■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.36■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.36■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA3Q08378 1498 aa20.36■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 CFAP44Q96MT7 982 aa20.34■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 GBP4Q96PP9 640 aa20.32■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 SMARCA2P51531 1590 aa20.3■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 EEA1Q15075 1411 aa20.3■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RXRA-201ENST00000356384 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 KIF27Q86VH2 1401 aa20.26■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 ABCC8Q09428 1581 aa20.26■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 PTMSP20962 102 aa20.24■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.24■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 PDE4CQ08493 712 aa20.23■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.22■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RXRA-201ENST00000356384 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 STK26Q9P289 416 aa20.2■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 TPM4P67936 248 aa20.2■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 SOGA1O94964 1423 aa20.2■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 KANK1Q14678 1352 aa20.19■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 SMARCA4P51532 1647 aa20.18■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.18■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 GGT6Q6P531 493 aa20.17■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 CCER2I3L3R5 266 aa20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 GORABQ5T7V8 394 aa20.15■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.15■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.14■□□□□ 0.82
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.14■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.14■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.13■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.13■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.12■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.12■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.12■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.1■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.1■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 CUX2O14529 1486 aa20.08■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.08■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 GPATCH3Q96I76 525 aa20.08■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 STK31Q9BXU1 1019 aa20.08■□□□□ 0.81
RXRA-201ENST00000356384 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.08■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.06■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.04■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 FOXD1Q16676 465 aa20.03■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.03■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 PKD2Q13563 968 aa20.03■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 HMMRO75330 724 aa20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 TPM3P06753 285 aa20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RXRA-201ENST00000356384 CEP89Q96ST8 783 aa20.01■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 TOMM22Q9NS69 142 aa20.01■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.01■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 RALBP1Q15311 655 aa20■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.98■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 VPS53Q5VIR6 699 aa19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 G3V3G9 751 aa19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RXRA-201ENST00000356384 MARCH6O60337 910 aa19.97■□□□□ 0.79
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