RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC5O15440 1437 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 GRIN2AQ12879 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 ARID3CA6NKF2 412 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS3-201ENST00000355530 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.39■■□□□ 1.65
SPNS3-201ENST00000355530 NCOA1Q15788 1441 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS3-201ENST00000355530 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS3-201ENST00000355530 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SPNS3-201ENST00000355530 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC7Q96M83 1385 aa25.33■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 FOXD1Q16676 465 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 PZPP20742 1482 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRL2O95490 1459 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 CEP170Q5SW79 1584 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 KIF14Q15058 1648 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 SYNJ2O15056 1496 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 MBD5Q9P267 1494 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-201ENST00000355530 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-201ENST00000355530 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC184Q52MB2 194 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 MRS2Q9HD23 443 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 ERCC6Q03468 1493 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA8O94911 1581 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 KDM5CP41229 1560 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 USP47Q96K76 1375 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-201ENST00000355530 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 PKD2Q13563 968 aa25■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 JPH4Q96JJ6 628 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS3-201ENST00000355530 ATP10BO94823 1461 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 FBLN2P98095 1184 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 NUP155O75694 1391 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRGP23470 1445 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS3-201ENST00000355530 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 KIF15Q9NS87 1388 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 PREX2Q70Z35 1606 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 TSPY4P0CV99 314 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 TSPY10P0CW01 314 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 E9PCH4 1651 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS3-201ENST00000355530 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 NUDCQ9Y266 331 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 UNC13BO14795 1591 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
SPNS3-201ENST00000355530 MSH5O43196 834 aa24.72■■□□□ 1.55
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