RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349553.9

CALB2-202, Transcript of calbindin 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CALB2, Length 1,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2-202ENST00000349553 PLCH2O75038 1416 aa29.13■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 HECW1Q76N89 1606 aa29.12■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.12■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.11■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 FMN1Q68DA7 1419 aa29.08■■■□□ 2.25
CALB2-202ENST00000349553 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.07■■■□□ 2.24
CALB2-202ENST00000349553 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.05■■■□□ 2.24
CALB2-202ENST00000349553 ATP10AO60312 1499 aa29.02■■■□□ 2.24
CALB2-202ENST00000349553 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.02■■■□□ 2.24
CALB2-202ENST00000349553 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.01■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.98■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 AFAP1Q8N556 730 aa28.96■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 KIF14Q15058 1648 aa28.96■■■□□ 2.23
CALB2-202ENST00000349553 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.95■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 CLIP1P30622 1438 aa28.94■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.91■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.9■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.9■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 CERKQ8TCT0 537 aa28.9■■■□□ 2.22
CALB2-202ENST00000349553 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.81■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 KDM5CP41229 1560 aa28.8■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.79■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.76■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.76■■■□□ 2.2
CALB2-202ENST00000349553 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.75■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.74■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.74■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.72■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.71■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.71■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 ABCA6Q8N139 1617 aa28.71■■■□□ 2.19
CALB2-202ENST00000349553 PREX2Q70Z35 1606 aa28.69■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 ABCC1P33527 1531 aa28.68■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 REREQ9P2R6 1566 aa28.67■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.64■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 STRCQ7RTU9 1775 aa28.64■■■□□ 2.18
CALB2-202ENST00000349553 C3P01024 1663 aa28.62■■■□□ 2.17
CALB2-202ENST00000349553 AGLP35573 1532 aa28.61■■■□□ 2.17
CALB2-202ENST00000349553 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.59■■■□□ 2.17
CALB2-202ENST00000349553 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
CALB2-202ENST00000349553 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.57■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.56■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.56■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 PTPRTO14522 1441 aa28.53■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.52■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.51■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
CALB2-202ENST00000349553 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CALB2-202ENST00000349553 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.49■■■□□ 2.15
CALB2-202ENST00000349553 ZMYM3Q14202 1370 aa28.47■■■□□ 2.15
CALB2-202ENST00000349553 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.46■■■□□ 2.15
CALB2-202ENST00000349553 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CALB2-202ENST00000349553 NCOA1Q15788 1441 aa28.44■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 GGT6Q6P531 493 aa28.44■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.43■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 ATP7AQ04656 1500 aa28.41■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 NPATQ14207 1427 aa28.41■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.41■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.4■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.4■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.4■■■□□ 2.14
CALB2-202ENST00000349553 A2MP01023 1474 aa28.38■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 MROH2AA6NES4 1674 aa28.37■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.37■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 ILDR2Q71H61 639 aa28.36■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CALB2-202ENST00000349553 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 PLXNC1O60486 1568 aa28.29■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 PTPRKQ15262 1439 aa28.28■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 PKD2Q13563 968 aa28.27■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
CALB2-202ENST00000349553 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.25■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.24■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.24■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 TIAM1Q13009 1591 aa28.22■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.22■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 SOCS7O14512 581 aa28.22■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.22■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.2■■■□□ 2.11
CALB2-202ENST00000349553 PLA2R1Q13018 1463 aa28.2■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 MBD5Q9P267 1494 aa28.19■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 KIF3BO15066 747 aa28.18■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.16■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 CEP162Q5TB80 1403 aa28.15■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CALB2-202ENST00000349553 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms