RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342835.8

SPTB-201, Transcript of spectrin beta, erythrocytic, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPTB, Length 1,723 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTB-201ENST00000342835 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.04■■■□□ 2.72
SPTB-201ENST00000342835 ABCC5O15440 1437 aa32.03■■■□□ 2.72
SPTB-201ENST00000342835 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.02■■■□□ 2.72
SPTB-201ENST00000342835 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32■■■□□ 2.71
SPTB-201ENST00000342835 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.97■■■□□ 2.71
SPTB-201ENST00000342835 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.96■■■□□ 2.71
SPTB-201ENST00000342835 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.96■■■□□ 2.71
SPTB-201ENST00000342835 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.96■■■□□ 2.71
SPTB-201ENST00000342835 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
SPTB-201ENST00000342835 OSCARQ8IYS5 282 aa31.92■■■□□ 2.7
SPTB-201ENST00000342835 ADGRL2O95490 1459 aa31.9■■■□□ 2.7
SPTB-201ENST00000342835 PREX2Q70Z35 1606 aa31.9■■■□□ 2.7
SPTB-201ENST00000342835 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.89■■■□□ 2.7
SPTB-201ENST00000342835 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.88■■■□□ 2.69
SPTB-201ENST00000342835 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SPTB-201ENST00000342835 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
SPTB-201ENST00000342835 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SPTB-201ENST00000342835 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.84■■■□□ 2.69
SPTB-201ENST00000342835 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.82■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 KDM6BO15054 1643 aa31.8■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 NCOA1Q15788 1441 aa31.8■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.78■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.78■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 TRIM52Q96A61 297 aa31.78■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.77■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.77■■■□□ 2.68
SPTB-201ENST00000342835 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.76■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 NEUROD1Q13562 356 aa31.75■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.75■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.74■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.72■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.72■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.71■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.7■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 TSPY4P0CV99 314 aa31.7■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 TSPY10P0CW01 314 aa31.7■■■□□ 2.67
SPTB-201ENST00000342835 TONSLQ96HA7 1378 aa31.7■■■□□ 2.66
SPTB-201ENST00000342835 MBD5Q9P267 1494 aa31.68■■■□□ 2.66
SPTB-201ENST00000342835 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.67■■■□□ 2.66
SPTB-201ENST00000342835 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.64■■■□□ 2.66
SPTB-201ENST00000342835 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 PLCH2O75038 1416 aa31.62■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.62■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.61■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.61■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.59■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.58■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.58■■■□□ 2.65
SPTB-201ENST00000342835 KCNH8Q96L42 1107 aa31.57■■■□□ 2.64
SPTB-201ENST00000342835 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.53■■■□□ 2.64
SPTB-201ENST00000342835 KIF15Q9NS87 1388 aa31.53■■■□□ 2.64
SPTB-201ENST00000342835 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
SPTB-201ENST00000342835 PZPP20742 1482 aa31.51■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.5■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 PLXNC1O60486 1568 aa31.48■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.48■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 ABCC1P33527 1531 aa31.46■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.45■■■□□ 2.63
SPTB-201ENST00000342835 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 ASXL2Q76L83 1435 aa31.41■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
SPTB-201ENST00000342835 NUP155O75694 1391 aa31.36■■■□□ 2.61
SPTB-201ENST00000342835 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.36■■■□□ 2.61
SPTB-201ENST00000342835 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.35■■■□□ 2.61
SPTB-201ENST00000342835 FOXD1Q16676 465 aa31.32■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 UNC13BO14795 1591 aa31.31■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.3■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 ERBINQ96RT1 1412 aa31.3■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 FANCAO15360 1455 aa31.29■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 PKD2Q13563 968 aa31.29■■■□□ 2.6
SPTB-201ENST00000342835 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.26■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.24■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.23■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.22■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.21■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
SPTB-201ENST00000342835 MIER1Q8N108 512 aa31.19■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.18■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.18■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 ADGRL1O94910 1474 aa31.17■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.17■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.17■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
SPTB-201ENST00000342835 ATP7AQ04656 1500 aa31.11■■■□□ 2.57
SPTB-201ENST00000342835 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.1■■■□□ 2.57
SPTB-201ENST00000342835 CD109Q6YHK3 1445 aa31.08■■■□□ 2.57
SPTB-201ENST00000342835 AFAP1Q8N556 730 aa31.06■■■□□ 2.56
SPTB-201ENST00000342835 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
SPTB-201ENST00000342835 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.04■■■□□ 2.56
SPTB-201ENST00000342835 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
SPTB-201ENST00000342835 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
SPTB-201ENST00000342835 DEPDC5O75140 1603 aa30.99■■■□□ 2.55
SPTB-201ENST00000342835 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
SPTB-201ENST00000342835 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.98■■■□□ 2.55
SPTB-201ENST00000342835 NEO1Q92859 1461 aa30.97■■■□□ 2.55
SPTB-201ENST00000342835 ATP10AO60312 1499 aa30.97■■■□□ 2.55
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