RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 KIF3AQ9Y496 699 aa10.29□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PKHD1-201ENST00000340994 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.27□□□□□ -0.76
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PKHD1-201ENST00000340994 FBLN2P98095 1184 aa10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1-201ENST00000340994 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10.26□□□□□ -0.77
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PKHD1-201ENST00000340994 TPM1P09493 284 aa10.23□□□□□ -0.77
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PKHD1-201ENST00000340994 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.23□□□□□ -0.77
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PKHD1-201ENST00000340994 HMMRO75330 724 aa10.22□□□□□ -0.77
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PKHD1-201ENST00000340994 TMF1P82094 1093 aa10.2□□□□□ -0.78
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PKHD1-201ENST00000340994 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1-201ENST00000340994 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1-201ENST00000340994 CLSTN1O94985 981 aa10.16□□□□□ -0.78
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PKHD1-201ENST00000340994 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.16□□□□□ -0.78
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PKHD1-201ENST00000340994 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.14□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 CCP110O43303 1012 aa10.14□□□□□ -0.79
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PKHD1-201ENST00000340994 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
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PKHD1-201ENST00000340994 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 MYO6Q9UM54 1294 aa10.1□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 H0YHG0 523 aa10.1□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.09□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.09□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.09□□□□□ -0.79
PKHD1-201ENST00000340994 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
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