RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ACTB-201ENST00000331789 AKNAQ7Z591 1439 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-201ENST00000331789 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ACTB-201ENST00000331789 KDM6BO15054 1643 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-201ENST00000331789 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-201ENST00000331789 ROCK1Q13464 1354 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-201ENST00000331789 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ACTB-201ENST00000331789 NEUROD1Q13562 356 aa26.08■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 OSCARQ8IYS5 282 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 TRIM52Q96A61 297 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 PREX2Q70Z35 1606 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-201ENST00000331789 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
ACTB-201ENST00000331789 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.752e-34■■■■□ 20.9
ACTB-201ENST00000331789 KCNH8Q96L42 1107 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-201ENST00000331789 NCOA1Q15788 1441 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-201ENST00000331789 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-201ENST00000331789 ADGRL2O95490 1459 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.743e-29■□□□□ 9.6
ACTB-201ENST00000331789 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 MBD5Q9P267 1494 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-201ENST00000331789 TSPY4P0CV99 314 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-201ENST00000331789 TSPY10P0CW01 314 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-201ENST00000331789 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACTB-201ENST00000331789 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-201ENST00000331789 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 TONSLQ96HA7 1378 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 FOXD1Q16676 465 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 PLCH2O75038 1416 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.8■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.8■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 PZPP20742 1482 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 KIF15Q9NS87 1388 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 ASXL2Q76L83 1435 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-201ENST00000331789 ABCC1P33527 1531 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-201ENST00000331789 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-201ENST00000331789 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-201ENST00000331789 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
ACTB-201ENST00000331789 NUP155O75694 1391 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-201ENST00000331789 PKD2Q13563 968 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 PLXNC1O60486 1568 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 MIER1Q8N108 512 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-201ENST00000331789 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTB-201ENST00000331789 FANCAO15360 1455 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTB-201ENST00000331789 AFAP1Q8N556 730 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-201ENST00000331789 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-201ENST00000331789 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-201ENST00000331789 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 UNC13BO14795 1591 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 ADGRL1O94910 1474 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.672e-37■□□□□ 8.4
ACTB-201ENST00000331789 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 ERBINQ96RT1 1412 aa25.45■■□□□ 1.67
ACTB-201ENST00000331789 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 CD109Q6YHK3 1445 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 ATP7AQ04656 1500 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-201ENST00000331789 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-201ENST00000331789 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
ACTB-201ENST00000331789 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-201ENST00000331789 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-201ENST00000331789 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACTB-201ENST00000331789 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-201ENST00000331789 PLA2R1Q13018 1463 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-201ENST00000331789 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
ACTB-201ENST00000331789 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms