RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.9■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 HECW1Q76N89 1606 aa24.9■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.9■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.9■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.88■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.87■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 NUP160Q12769 1436 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PKP3-201ENST00000331563 IL27Q8NEV9 243 aa24.81■■□□□ 1.56
PKP3-201ENST00000331563 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PKP3-201ENST00000331563 TONSLQ96HA7 1378 aa24.78■■□□□ 1.56
PKP3-201ENST00000331563 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 25.9
PKP3-201ENST00000331563 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.77■■□□□ 1.56
PKP3-201ENST00000331563 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.76■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 CHD1O14646 1710 aa24.74■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 ARHGEF11O15085 1522 aa24.74■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PKP3-201ENST00000331563 NAIPQ13075 1403 aa24.69■■□□□ 1.54
PKP3-201ENST00000331563 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.68■■□□□ 1.54
PKP3-201ENST00000331563 HFM1A2PYH4 1435 aa24.66■■□□□ 1.54
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PKP3-201ENST00000331563 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.61■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 PTPRGP23470 1445 aa24.6■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 FOXD1Q16676 465 aa24.6■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 CCDC184Q52MB2 194 aa24.59■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PKP3-201ENST00000331563 KIF14Q15058 1648 aa24.58■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 MIA2Q96PC5 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.57■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 ATP10BO94823 1461 aa24.56■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 KDM6BO15054 1643 aa24.56■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 MRS2Q9HD23 443 aa24.55■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 UACAQ9BZF9 1416 aa24.53■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.52■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.52■■□□□ 1.52
PKP3-201ENST00000331563 ABCC5O15440 1437 aa24.51■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 DAPK1P53355 1430 aa24.5■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 ABCA8O94911 1581 aa24.49■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.49■■□□□ 1.51
PKP3-201ENST00000331563 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.44■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.43■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PKP3-201ENST00000331563 NEFMP07197 916 aa24.39■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 SHROOM2Q13796 1616 aa24.36■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.35■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 AKNAQ7Z591 1439 aa24.35■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.34■■□□□ 1.49
PKP3-201ENST00000331563 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.32■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.3■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 ROCK1Q13464 1354 aa24.29■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 NCOA1Q15788 1441 aa24.29■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.29■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.29■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.29■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.28■■□□□ 1.48
PKP3-201ENST00000331563 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.27■■□□□ 1.48
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PKP3-201ENST00000331563 TSPY10P0CW01 314 aa24.26■■□□□ 1.47
PKP3-201ENST00000331563 NUDCQ9Y266 331 aa24.25■■□□□ 1.47
PKP3-201ENST00000331563 USP35Q9P2H5 1018 aa24.25■■□□□ 1.47
PKP3-201ENST00000331563 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.23■■□□□ 1.47
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PKP3-201ENST00000331563 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.2■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 ABCC2Q92887 1545 aa24.19■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.18■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.18■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 PKD2Q13563 968 aa24.17■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.16■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.16■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.15■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.15■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.14■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.14■■□□□ 1.46
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