RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

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Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-201ENST00000327359 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.42■■□□□ 1.18
BRF1-201ENST00000327359 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
BRF1-201ENST00000327359 CHD1O14646 1710 aa22.4■■□□□ 1.18
BRF1-201ENST00000327359 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 HFM1A2PYH4 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 MIA2Q96PC5 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 NAIPQ13075 1403 aa22.36■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
BRF1-201ENST00000327359 PTPRGP23470 1445 aa22.3■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 ABCA8O94911 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.29■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.28■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 KIF14Q15058 1648 aa22.27■■□□□ 1.16
BRF1-201ENST00000327359 ATP10BO94823 1461 aa22.27■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 UACAQ9BZF9 1416 aa22.26■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 TONSLQ96HA7 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 DAPK1P53355 1430 aa22.23■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 ABCC5O15440 1437 aa22.21■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 KDM6BO15054 1643 aa22.21■■□□□ 1.15
BRF1-201ENST00000327359 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.19■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.19■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 SHROOM2Q13796 1616 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 AKNAQ7Z591 1439 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-201ENST00000327359 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 ROCK1Q13464 1354 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 FOXD1Q16676 465 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-201ENST00000327359 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
BRF1-201ENST00000327359 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.05■■□□□ 1.12
BRF1-201ENST00000327359 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-201ENST00000327359 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-201ENST00000327359 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-201ENST00000327359 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 28
BRF1-201ENST00000327359 NCOA1Q15788 1441 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 CCDC184Q52MB2 194 aa22■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 ABCC2Q92887 1545 aa21.99■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.98■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.97■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.97■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 TSPY4P0CV99 314 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 TSPY10P0CW01 314 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-201ENST00000327359 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.95■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.94■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 ADGRL2O95490 1459 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 33.4
BRF1-201ENST00000327359 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.89■■□□□ 1.1
BRF1-201ENST00000327359 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 PREX2Q70Z35 1606 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.88■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.88■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 36.9
BRF1-201ENST00000327359 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 PZPP20742 1482 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 MBD5Q9P267 1494 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.86■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.85■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 PKD2Q13563 968 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 KIF15Q9NS87 1388 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 MRS2Q9HD23 443 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-201ENST00000327359 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.83■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 NUP155O75694 1391 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 CCDC7Q96M83 1385 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 OSCARQ8IYS5 282 aa21.78■■□□□ 1.08
BRF1-201ENST00000327359 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.76■■□□□ 1.07
BRF1-201ENST00000327359 NBR1Q14596 966 aa21.76■■□□□ 1.07
BRF1-201ENST00000327359 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.75■■□□□ 1.07
BRF1-201ENST00000327359 PLCH2O75038 1416 aa21.74■■□□□ 1.07
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