RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 SAMD9Q5K651 1589 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 USP35Q9P2H5 1018 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 OSCARQ8IYS5 282 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 MSH5O43196 834 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 TMC1Q8TDI8 760 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 PDE3BQ13370 1112 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 PTPRKQ15262 1439 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 ARHGEF11O15085 1522 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 RALBP1Q15311 655 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 NESP48681 1621 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 MS4A1P11836 297 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 KIF15Q9NS87 1388 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-202ENST00000320122 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 DAPK1P53355 1430 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 USP47Q96K76 1375 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 IQGAP2Q13576 1575 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 NBR1Q14596 966 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 INSRP06213 1382 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 ARID3CA6NKF2 412 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 NLRP13Q86W25 1043 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.52□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.52□□□□□ -1.04
LMO3-202ENST00000320122 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ABCC5O15440 1437 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 TSPY4P0CV99 314 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 TSPY10P0CW01 314 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 WDR62O43379 1518 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 KIF14Q15058 1648 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 PKD2Q13563 968 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 CCDC184Q52MB2 194 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ADGRL2O95490 1459 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 NEFMP07197 916 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 PDE4AP27815 886 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 CDCA8Q53HL2 280 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 FOXD1Q16676 465 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
LMO3-202ENST00000320122 MBD5Q9P267 1494 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-202ENST00000320122 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-202ENST00000320122 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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