RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 ROCK1Q13464 1354 aa26.85■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.85■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.83■■□□□ 1.89
HCLS1-201ENST00000314583 PREX2Q70Z35 1606 aa26.81■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.79■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.78■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 KDM6BO15054 1643 aa26.78■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 OSCARQ8IYS5 282 aa26.77■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.77■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.77■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.76■■□□□ 1.88
HCLS1-201ENST00000314583 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 ADGRL2O95490 1459 aa26.74■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.73■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.71■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.71■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.7■■□□□ 1.87
HCLS1-201ENST00000314583 NEUROD1Q13562 356 aa26.69■■□□□ 1.86
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HCLS1-201ENST00000314583 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.69■■□□□ 1.86
HCLS1-201ENST00000314583 NCOA1Q15788 1441 aa26.66■■□□□ 1.86
HCLS1-201ENST00000314583 MBD5Q9P267 1494 aa26.65■■□□□ 1.86
HCLS1-201ENST00000314583 TONSLQ96HA7 1378 aa26.62■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.6■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM52Q96A61 297 aa26.59■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.57■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.57■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 PLCH2O75038 1416 aa26.56■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.54■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.54■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.54■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.53■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 KCNH8Q96L42 1107 aa26.53■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.53■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.53■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
HCLS1-201ENST00000314583 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.51■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.48■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 MIER1Q8N108 512 aa26.48■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 TSPY4P0CV99 314 aa26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 TSPY10P0CW01 314 aa26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC1P33527 1531 aa26.46■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.45■■□□□ 1.83
HCLS1-201ENST00000314583 PZPP20742 1482 aa26.45■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 ASXL2Q76L83 1435 aa26.45■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.41■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 KIF15Q9NS87 1388 aa26.41■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 PLXNC1O60486 1568 aa26.41■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.4■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.39■■□□□ 1.82
HCLS1-201ENST00000314583 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HCLS1-201ENST00000314583 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HCLS1-201ENST00000314583 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.3■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 FANCAO15360 1455 aa26.29■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 FOXD1Q16676 465 aa26.28■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 UNC13BO14795 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-201ENST00000314583 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.26■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.26■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.26■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 NUP155O75694 1391 aa26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.23■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 ERBINQ96RT1 1412 aa26.21■■□□□ 1.79
HCLS1-201ENST00000314583 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.2■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 ADGRL1O94910 1474 aa26.18■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.18■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 PKD2Q13563 968 aa26.18■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.18■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.18■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.15■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 CD109Q6YHK3 1445 aa26.14■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.14■■□□□ 1.78
HCLS1-201ENST00000314583 ATP7AQ04656 1500 aa26.14■■□□□ 1.77
HCLS1-201ENST00000314583 AFAP1Q8N556 730 aa26.12■■□□□ 1.77
HCLS1-201ENST00000314583 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HCLS1-201ENST00000314583 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HCLS1-201ENST00000314583 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HCLS1-201ENST00000314583 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 GLI2P10070 1586 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 DEPDC5O75140 1603 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.04■■□□□ 1.76
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