RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIAM1Q13009 1591 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 FMN1Q68DA7 1419 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.26■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGF1RP08069 1367 aa19.25■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPRKQ15262 1439 aa19.25■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.25■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 MS4A1P11836 297 aa19.24■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.24■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.23■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 POGKQ9P215 609 aa19.23■□□□□ 0.67
CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.2■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 TOP2BQ02880 1626 aa19.2■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAIPQ13075 1403 aa19.17■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.17■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOA1Q15788 1441 aa19.16■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 HFM1A2PYH4 1435 aa19.15■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM161AQ3B820 660 aa19.14■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZMYND15Q9H091 742 aa19.14■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.14■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.13■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP47Q96K76 1375 aa19.12■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUX1P39880 1505 aa19.1■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGL3Q3MIN7 710 aa19.1■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARID3AQ99856 593 aa19.09■□□□□ 0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 BECN1Q14457 450 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOA2Q15596 1464 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKD2Q13563 968 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 NLRP13Q86W25 1043 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFTRP13569 1480 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP3K1Q13233 1512 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 RALBP1Q15311 655 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 PANK2Q9BZ23 570 aa19■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF15Q9NS87 1388 aa19■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE3BQ13370 1112 aa18.99■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.99■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.98■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf34Q49A92 452 aa18.97■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEUROD2Q15784 382 aa18.96■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.96■□□□□ 0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.94■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.94■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.92■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.92■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEC24BO95487 1268 aa18.92■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.92■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBLN2P98095 1184 aa18.91■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.9■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.9■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCAPD3P42695 1498 aa18.89■□□□□ 0.62
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.88■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCAR3O75815 825 aa18.88■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 PANK3Q9H999 370 aa18.88■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 COG6Q9Y2V7 657 aa18.88■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.615e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.88■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.87■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA2Q08379 1002 aa18.86■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.86■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.86■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.85■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 PANK1Q8TE04 598 aa18.83■□□□□ 0.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHDP01880 384 aa18.81■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.81■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.8■□□□□ 0.6
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