RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299106.8

JAM3-201, Transcript of junctional adhesion molecule 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene JAM3, Length 3,912 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3-201ENST00000299106 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.16■□□□□ 0.18
JAM3-201ENST00000299106 KIF27Q86VH2 1401 aa16.16■□□□□ 0.18
JAM3-201ENST00000299106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
JAM3-201ENST00000299106 POGKQ9P215 609 aa16.15■□□□□ 0.18
JAM3-201ENST00000299106 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
JAM3-201ENST00000299106 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.13■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.13■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.13■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.13■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.12■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.11■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 CUX2O14529 1486 aa16.1■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.1■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 FAM161AQ3B820 660 aa16.1■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
JAM3-201ENST00000299106 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.06■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.04■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 SMARCA4P51532 1647 aa16.04■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.04■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 FMN1Q68DA7 1419 aa16.03■□□□□ 0.16
JAM3-201ENST00000299106 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.02■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 UACAQ9BZF9 1416 aa16.02■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.99■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.98■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.98■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 RRP9O43818 475 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.97■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 PDE4CQ08493 712 aa15.97■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 PRXQ9BXM0 1461 aa15.96■□□□□ 0.15
JAM3-201ENST00000299106 PANK2Q9BZ23 570 aa15.95■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 PDE3BQ13370 1112 aa15.93■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.92■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 NLRP13Q86W25 1043 aa15.91■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.91■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 TIAM1Q13009 1591 aa15.91■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 RALBP1Q15311 655 aa15.9■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 RGL3Q3MIN7 710 aa15.9■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.9■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.9■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 USP47Q96K76 1375 aa15.9■□□□□ 0.14
JAM3-201ENST00000299106 NCOA1Q15788 1441 aa15.88■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 NEUROD2Q15784 382 aa15.88■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.88■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 KIF15Q9NS87 1388 aa15.87■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 ESPNB1AK53 854 aa15.86■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.85■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 TRAK2O60296 914 aa15.84■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 C8orf34Q49A92 452 aa15.83■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.83■□□□□ 0.13
JAM3-201ENST00000299106 HFM1A2PYH4 1435 aa15.82■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 NAIPQ13075 1403 aa15.82■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 CLCN1P35523 988 aa15.82■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 PKD2Q13563 968 aa15.82■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 MRE11P49959 708 aa15.81■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.81■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 HSCBQ8IWL3 235 aa15.8■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 COG6Q9Y2V7 657 aa15.8■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 GOLGA2Q08379 1002 aa15.8■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 PTPRKQ15262 1439 aa15.79■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.79■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 MAP3K1Q13233 1512 aa15.78■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 IGF1RP08069 1367 aa15.78■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 MCM4P33991 863 aa15.78■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.78■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
JAM3-201ENST00000299106 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 NCOA2Q15596 1464 aa15.77■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 SEC24BO95487 1268 aa15.76■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.75■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.75■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.75■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.75■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 BCAR3O75815 825 aa15.74■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.74■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.74■□□□□ 0.11
JAM3-201ENST00000299106 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms