RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.28■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.27■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.26■■■■□ 3.07
PKDCC-201ENST00000294964 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
PKDCC-201ENST00000294964 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.25■■■■□ 3.07
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF11O15085 1522 aa34.2■■■■□ 3.07
PKDCC-201ENST00000294964 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 ANP32CO43423 234 aa34.19■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 HFM1A2PYH4 1435 aa34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 NAIPQ13075 1403 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 TONSLQ96HA7 1378 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 UACAQ9BZF9 1416 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-201ENST00000294964 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC2Q92887 1545 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.09■■■■□ 3.05
PKDCC-201ENST00000294964 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-201ENST00000294964 ATP10BO94823 1461 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-201ENST00000294964 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.02■■■■□ 3.04
PKDCC-201ENST00000294964 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD1Q16676 465 aa33.99■■■■□ 3.03
PKDCC-201ENST00000294964 KDM6BO15054 1643 aa33.94■■■■□ 3.02
PKDCC-201ENST00000294964 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
PKDCC-201ENST00000294964 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP33.92■■■■□ 3.02
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
PKDCC-201ENST00000294964 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.9■■■■□ 3.02
PKDCC-201ENST00000294964 NBR1Q14596 966 aa33.87■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 PPP4R2Q9NY27 417 aa33.87■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 ERICH6BQ5W0A0 696 aa33.85■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.83■■■■□ 3.01
PKDCC-201ENST00000294964 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PKDCC-201ENST00000294964 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.81■■■■□ 3
PKDCC-201ENST00000294964 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PKDCC-201ENST00000294964 KIF14Q15058 1648 aa33.77■■■■□ 3
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.75■■■□□ 2.99
PKDCC-201ENST00000294964 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
PKDCC-201ENST00000294964 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
PKDCC-201ENST00000294964 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.71■■■□□ 2.99
PKDCC-201ENST00000294964 MIA2Q96PC5 1412 aa33.7■■■□□ 2.99
PKDCC-201ENST00000294964 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa33.7■■■□□ 2.98
PKDCC-201ENST00000294964 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.69■■■□□ 2.98
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
PKDCC-201ENST00000294964 DAPK1P53355 1430 aa33.64■■■□□ 2.98
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC5O15440 1437 aa33.62■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.61■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 ASXL2Q76L83 1435 aa33.6■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.6■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.59■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.59■■■□□ 2.97
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 AKNAQ7Z591 1439 aa33.55■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.55■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.54■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.53■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.52■■■□□ 2.96
PKDCC-201ENST00000294964 IL27Q8NEV9 243 aa33.5■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.49■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.49■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC136Q96JN2 1154 aa33.47■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.46■■■□□ 2.95
PKDCC-201ENST00000294964 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 ROCK1Q13464 1354 aa33.43■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC184Q52MB2 194 aa33.42■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.42■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 PREX2Q70Z35 1606 aa33.41■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.4■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.4■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.39■■■□□ 2.94
PKDCC-201ENST00000294964 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
PKDCC-201ENST00000294964 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
PKDCC-201ENST00000294964 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
PKDCC-201ENST00000294964 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
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PKDCC-201ENST00000294964 ZBED9Q6R2W3 1325 aa33.29■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.28■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.28■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 PLCH2O75038 1416 aa33.27■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 PZPP20742 1482 aa33.27■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 FAM9BQ8IZU0 186 aa33.27■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 PKD2Q13563 968 aa33.27■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.26■■■□□ 2.92
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC7Q96M83 1385 aa33.26■■■□□ 2.91
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
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