RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC5O15440 1437 aa31.42■■■□□ 2.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.36■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.35■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.34■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.34■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.33■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.32■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM6BO15054 1643 aa31.31■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 PREX2Q70Z35 1606 aa31.29■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 OSCARQ8IYS5 282 aa31.29■■■□□ 2.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRL2O95490 1459 aa31.25■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.23■■■□□ 2.595e-7■■■□□ 18.3
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.23■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.22■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.22■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.22■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.2■■■□□ 2.59
SNRNP25-201ENST00000293861 NCOA1Q15788 1441 aa31.18■■■□□ 2.58
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.16■■■□□ 2.58
SNRNP25-201ENST00000293861 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.16■■■□□ 2.58
SNRNP25-201ENST00000293861 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.13■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 NEUROD1Q13562 356 aa31.13■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MBD5Q9P267 1494 aa31.11■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.1■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.09■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.08■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM52Q96A61 297 aa31.08■■■□□ 2.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.07■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.06■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNH8Q96L42 1107 aa31.04■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY4P0CV99 314 aa31.04■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY10P0CW01 314 aa31.04■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.04■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PLCH2O75038 1416 aa31.04■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.03■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.02■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TONSLQ96HA7 1378 aa31.01■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SYCP2Q9BX26 1530 aa31■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.98■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.98■■■□□ 2.55
SNRNP25-201ENST00000293861 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.92■■■□□ 2.54
SNRNP25-201ENST00000293861 PZPP20742 1482 aa30.92■■■□□ 2.54
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF15Q9NS87 1388 aa30.9■■■□□ 2.54
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.9■■■□□ 2.54
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC1P33527 1531 aa30.88■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ASXL2Q76L83 1435 aa30.88■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.87■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.86■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PLXNC1O60486 1568 aa30.85■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.84■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
SNRNP25-201ENST00000293861 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD1Q16676 465 aa30.75■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MIER1Q8N108 512 aa30.74■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCAO15360 1455 aa30.73■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP155O75694 1391 aa30.72■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.71■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.71■■■□□ 2.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.69■■■□□ 2.5
SNRNP25-201ENST00000293861 UNC13BO14795 1591 aa30.68■■■□□ 2.5
SNRNP25-201ENST00000293861 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.68■■■□□ 2.5
SNRNP25-201ENST00000293861 ERBINQ96RT1 1412 aa30.66■■■□□ 2.5
SNRNP25-201ENST00000293861 PKD2Q13563 968 aa30.65■■■□□ 2.5
SNRNP25-201ENST00000293861 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.63■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.61■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRL1O94910 1474 aa30.61■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.61■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.59■■■□□ 2.49
SNRNP25-201ENST00000293861 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.57■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.57■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.57■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.57■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.56■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.56■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CD109Q6YHK3 1445 aa30.54■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 AFAP1Q8N556 730 aa30.54■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP7AQ04656 1500 aa30.53■■■□□ 2.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.45■■■□□ 2.47
SNRNP25-201ENST00000293861 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.44■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.41■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 NEO1Q92859 1461 aa30.4■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 DEPDC5O75140 1603 aa30.4■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SNRNP25-201ENST00000293861 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.466e-9■■■■■ 30.4
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
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