RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CXCL16-201ENST00000293778 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL16-201ENST00000293778 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CXCL16-201ENST00000293778 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.53■■■□□ 2.16
CXCL16-201ENST00000293778 ABCA8O94911 1581 aa28.51■■■□□ 2.15
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CXCL16-201ENST00000293778 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL16-201ENST00000293778 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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CXCL16-201ENST00000293778 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.46■■■□□ 2.15
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CXCL16-201ENST00000293778 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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CXCL16-201ENST00000293778 CHD1O14646 1710 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL16-201ENST00000293778 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL16-201ENST00000293778 PTPRGP23470 1445 aa28.34■■■□□ 2.13
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CXCL16-201ENST00000293778 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.25■■■□□ 2.11
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CXCL16-201ENST00000293778 SHROOM2Q13796 1616 aa28.22■■■□□ 2.11
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CXCL16-201ENST00000293778 ANP32CO43423 234 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL16-201ENST00000293778 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL16-201ENST00000293778 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.15■■■□□ 2.1
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CXCL16-201ENST00000293778 PREX2Q70Z35 1606 aa28.08■■■□□ 2.09
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CXCL16-201ENST00000293778 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.06■■■□□ 2.08
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CXCL16-201ENST00000293778 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.01
CXCL16-201ENST00000293778 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.63■■■□□ 2.01
CXCL16-201ENST00000293778 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.63■■■□□ 2.01
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CXCL16-201ENST00000293778 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.61■■■□□ 2.01
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