RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ERCC6Q03468 1493 aa11.78□□□□□ -0.52
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CUX1-201ENST00000292535 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.76□□□□□ -0.53
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CUX1-201ENST00000292535 KIF16BQ96L93 1317 aa11.63□□□□□ -0.55
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CUX1-201ENST00000292535 STK26Q9P289 416 aa11.58□□□□□ -0.56
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CUX1-201ENST00000292535 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
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CUX1-201ENST00000292535 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
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CUX1-201ENST00000292535 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.53□□□□□ -0.56
CUX1-201ENST00000292535 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.53□□□□□ -0.56
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