RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.21■■■□□ 2.27
CABP1-201ENST00000288616 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.2■■■□□ 2.27
CABP1-201ENST00000288616 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.2■■■□□ 2.27
CABP1-201ENST00000288616 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.19■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 FBXO41Q8TF61 875 aa29.19■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 HSPA2P54652 639 aa29.17■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.17■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.16■■■□□ 2.26
CABP1-201ENST00000288616 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.14■■■□□ 2.25
CABP1-201ENST00000288616 KIF14Q15058 1648 aa29.12■■■□□ 2.25
CABP1-201ENST00000288616 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.07■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 ATP10AO60312 1499 aa29.07■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.07■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 AFAP1Q8N556 730 aa29.04■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.04■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.03■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 CLIP1P30622 1438 aa29.03■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.03■■■□□ 2.24
CABP1-201ENST00000288616 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CABP1-201ENST00000288616 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.98■■■□□ 2.23
CABP1-201ENST00000288616 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.96■■■□□ 2.23
CABP1-201ENST00000288616 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.92■■■□□ 2.22
CABP1-201ENST00000288616 KDM5CP41229 1560 aa28.91■■■□□ 2.22
CABP1-201ENST00000288616 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.88■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.87■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.85■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.85■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.84■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 PREX2Q70Z35 1606 aa28.84■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 CERKQ8TCT0 537 aa28.84■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 ABCA6Q8N139 1617 aa28.83■■■□□ 2.21
CABP1-201ENST00000288616 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.81■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 ABCC1P33527 1531 aa28.8■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.78■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.77■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
CABP1-201ENST00000288616 REREQ9P2R6 1566 aa28.76■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.76■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.73■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.71■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 C3P01024 1663 aa28.71■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 STRCQ7RTU9 1775 aa28.7■■■□□ 2.19
CABP1-201ENST00000288616 AGLP35573 1532 aa28.7■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.69■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.65■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.64■■■□□ 2.18
CABP1-201ENST00000288616 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CABP1-201ENST00000288616 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.58■■■□□ 2.17
CABP1-201ENST00000288616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.58■■■□□ 2.17
CABP1-201ENST00000288616 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CABP1-201ENST00000288616 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.55■■■□□ 2.16
CABP1-201ENST00000288616 PTPRTO14522 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
CABP1-201ENST00000288616 ATP7AQ04656 1500 aa28.52■■■□□ 2.16
CABP1-201ENST00000288616 ZMYM3Q14202 1370 aa28.52■■■□□ 2.16
CABP1-201ENST00000288616 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.51■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.5■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 GGT6Q6P531 493 aa28.5■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 A2MP01023 1474 aa28.48■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 MROH2AA6NES4 1674 aa28.47■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 NCOA1Q15788 1441 aa28.47■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CABP1-201ENST00000288616 NPATQ14207 1427 aa28.45■■■□□ 2.14
CABP1-201ENST00000288616 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.43■■■□□ 2.14
CABP1-201ENST00000288616 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.42■■■□□ 2.14
CABP1-201ENST00000288616 PLXNC1O60486 1568 aa28.41■■■□□ 2.14
CABP1-201ENST00000288616 TIAM1Q13009 1591 aa28.4■■■□□ 2.14
CABP1-201ENST00000288616 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.38■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.36■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.35■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.35■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 MBD5Q9P267 1494 aa28.34■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 PTPRKQ15262 1439 aa28.34■■■□□ 2.13
CABP1-201ENST00000288616 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.32■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 CEP162Q5TB80 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.29■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.27■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 KIF3BO15066 747 aa28.26■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 PKD2Q13563 968 aa28.26■■■□□ 2.12
CABP1-201ENST00000288616 ILDR2Q71H61 639 aa28.24■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 PLA2R1Q13018 1463 aa28.23■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 NCOA2Q15596 1464 aa28.23■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.21■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.21■■■□□ 2.11
CABP1-201ENST00000288616 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CABP1-201ENST00000288616 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.5 ms