RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 ATP10BO94823 1461 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.66■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 ROCK1Q13464 1354 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 PTPRGP23470 1445 aa23.64■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 TONSLQ96HA7 1378 aa23.64■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.63■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 SHROOM2Q13796 1616 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC83-201ENST00000280245 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 FOXD1Q16676 465 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 NCOA1Q15788 1441 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCDC83-201ENST00000280245 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC83-201ENST00000280245 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC83-201ENST00000280245 ADGRL2O95490 1459 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC83-201ENST00000280245 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 PZPP20742 1482 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 ABCC2Q92887 1545 aa23.39■■□□□ 1.34
CCDC83-201ENST00000280245 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 PREX2Q70Z35 1606 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 MBD5Q9P267 1494 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.34■■□□□ 1.33
CCDC83-201ENST00000280245 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 TSPY4P0CV99 314 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 TSPY10P0CW01 314 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.29■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 KCNH8Q96L42 1107 aa23.28■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC83-201ENST00000280245 KIF15Q9NS87 1388 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 PKD2Q13563 968 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 NUP155O75694 1391 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.22■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.22■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.21■■□□□ 1.31
CCDC83-201ENST00000280245 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC83-201ENST00000280245 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
CCDC83-201ENST00000280245 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.17■■□□□ 1.3
CCDC83-201ENST00000280245 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC83-201ENST00000280245 PLCH2O75038 1416 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC83-201ENST00000280245 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC83-201ENST00000280245 ANP32CO43423 234 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC83-201ENST00000280245 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC83-201ENST00000280245 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 PLXNC1O60486 1568 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 CCER2I3L3R5 266 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 ABCC1P33527 1531 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCDC83-201ENST00000280245 UNC13BO14795 1591 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC7Q96M83 1385 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC83-201ENST00000280245 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 ERBINQ96RT1 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 AFAP1Q8N556 730 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 OSCARQ8IYS5 282 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 PLA2R1Q13018 1463 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 USP47Q96K76 1375 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC83-201ENST00000280245 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.9■■□□□ 1.26
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