RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278070.6

PPRC1-201, Transcript of peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPRC1, Length 5,330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1-201ENST00000278070 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.31■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.28■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PPRC1-201ENST00000278070 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.25■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 HSCBQ8IWL3 235 aa22.24■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.24■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 MS4A1P11836 297 aa22.23■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 NLRP13Q86W25 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 KIF21BO75037 1637 aa22.22■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 MORC1Q86VD1 984 aa22.22■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 USP35Q9P2H5 1018 aa22.21■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 PLCB2Q00722 1185 aa22.21■■□□□ 1.15
PPRC1-201ENST00000278070 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.2■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 POGKQ9P215 609 aa22.2■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.2■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 CASC1Q6TDU7 716 aa22.19■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 PDE3BQ13370 1112 aa22.17■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.16■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 ERCC6Q03468 1493 aa22.15■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.15■■□□□ 1.14
PPRC1-201ENST00000278070 IGF1RP08069 1367 aa22.13■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.13■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.13■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 GOLGA2Q08379 1002 aa22.12■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 GSE1Q14687 1217 aa22.12■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.12■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 KANK1Q14678 1352 aa22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 PLEKHG5O94827 1062 aa22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 C14orf37Q86TY3 774 aa22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 KIF15Q9NS87 1388 aa22.11■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 ARID3AQ99856 593 aa22.1■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.1■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.09■■□□□ 1.13
PPRC1-201ENST00000278070 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 PDE4AP27815 886 aa22.07■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.07■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 PLIN1O60240 522 aa22.06■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 USP47Q96K76 1375 aa22.05■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.04■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 GBP4Q96PP9 640 aa22.04■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 SLC4A3P48751 1232 aa22.03■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.03■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 ARAP1Q96P48 1450 aa22.02■■□□□ 1.12
PPRC1-201ENST00000278070 PANK3Q9H999 370 aa22.02■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.02■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 UACAQ9BZF9 1416 aa22■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 CCDC7Q96M83 1385 aa22■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.99■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 GGT6Q6P531 493 aa21.99■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.98■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.98■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.98■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.97■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 STK26Q9P289 416 aa21.97■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.97■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 PTMSP20962 102 aa21.96■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 CRBNQ96SW2 442 aa21.96■■□□□ 1.11
PPRC1-201ENST00000278070 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.95■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.94■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 SYNJ1O43426 1573 aa21.93■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.92■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.92■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.92■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.91■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.9■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 APBB1O00213 710 aa21.9■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 FAM161AQ3B820 660 aa21.9■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 JPH4Q96JJ6 628 aa21.9■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 KIF3BO15066 747 aa21.89■■□□□ 1.1
PPRC1-201ENST00000278070 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.89■■□□□ 1.09
PPRC1-201ENST00000278070 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms