RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 TRIM52Q96A61 297 aa21.27■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.26■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.26■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 KCNH8Q96L42 1107 aa21.25■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 AKNAQ7Z591 1439 aa21.24■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 ROCK1Q13464 1354 aa21.22■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.22■□□□□ 0.99
NICN1-201ENST00000273598 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.2■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.18■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 KDM6BO15054 1643 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 TSPY4P0CV99 314 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 TSPY10P0CW01 314 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
NICN1-201ENST00000273598 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.14■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 NCOA1Q15788 1441 aa21.12■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.12■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.11■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.1■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.1■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.09■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 PREX2Q70Z35 1606 aa21.09■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.08■□□□□ 0.97
NICN1-201ENST00000273598 TONSLQ96HA7 1378 aa21.07■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.07■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.06■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.06■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 ADGRL2O95490 1459 aa21.06■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.05■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.05■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 FOXD1Q16676 465 aa21.04■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 MBD5Q9P267 1494 aa21.03■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.02■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.02■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.02■□□□□ 0.96
NICN1-201ENST00000273598 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.01■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.01■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF5Q12774 1597 aa21■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 PLCH2O75038 1416 aa21■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.99■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.98■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 KIF15Q9NS87 1388 aa20.97■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.96■□□□□ 0.95
NICN1-201ENST00000273598 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.94■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 ASXL2Q76L83 1435 aa20.93■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 NUP155O75694 1391 aa20.92■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 PZPP20742 1482 aa20.9■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 PKD2Q13563 968 aa20.9■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.89■□□□□ 0.94
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.88■□□□□ 0.93
NICN1-201ENST00000273598 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.83■□□□□ 0.93
NICN1-201ENST00000273598 ABCC1P33527 1531 aa20.83■□□□□ 0.93
NICN1-201ENST00000273598 AFAP1Q8N556 730 aa20.83■□□□□ 0.93
NICN1-201ENST00000273598 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.83■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.83■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 FANCAO15360 1455 aa20.82■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.82■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.81■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.81■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 MIER1Q8N108 512 aa20.81■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
NICN1-201ENST00000273598 PLXNC1O60486 1568 aa20.76■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.75■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 ADGRL1O94910 1474 aa20.75■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.74■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.74■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 CD109Q6YHK3 1445 aa20.73■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.71■□□□□ 0.91
NICN1-201ENST00000273598 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.7■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 ERBINQ96RT1 1412 aa20.7■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.68■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.66■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 UNC13BO14795 1591 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-201ENST00000273598 ATP7AQ04656 1500 aa20.63■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 KIF3BO15066 747 aa20.6■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.59■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.59■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.59■□□□□ 0.89
NICN1-201ENST00000273598 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms