RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 MIA2Q96PC5 1412 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DAPK1P53355 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SLC20A1-201ENST00000272542 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF14Q15058 1648 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SLC20A1-201ENST00000272542 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP10BO94823 1461 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC20A1-201ENST00000272542 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SLC20A1-201ENST00000272542 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.33■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 AKNAQ7Z591 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PKD2Q13563 968 aa22.29■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ROCK1Q13464 1354 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ANP32CO43423 234 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TSPY4P0CV99 314 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 TSPY10P0CW01 314 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCA8O94911 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC20A1-201ENST00000272542 CHD1O14646 1710 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP155O75694 1391 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.141e-13■■■□□ 17.1
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 PZPP20742 1482 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC20A1-201ENST00000272542 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF15Q9NS87 1388 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC184Q52MB2 194 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 BCANQ96GW7 911 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC20A1-201ENST00000272542 RGL3Q3MIN7 710 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MBD5Q9P267 1494 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRL2O95490 1459 aa22.02■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP5Q13017 1502 aa22■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CCER2I3L3R5 266 aa22■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 AFAP1Q8N556 730 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC7Q96M83 1385 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.112e-8■□□□□ 10.1
SLC20A1-201ENST00000272542 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 FKBP8Q14318 412 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC2Q92887 1545 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 USP47Q96K76 1375 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 SHROOM2Q13796 1616 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC20A1-201ENST00000272542 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MRS2Q9HD23 443 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PREX2Q70Z35 1606 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 PLCH2O75038 1416 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.77■■□□□ 1.08
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