RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263097.8

CNN2-201, Transcript of calponin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN2, Length 2,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2-201ENST00000263097 ATP10BO94823 1461 aa20.57■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 PTPRGP23470 1445 aa20.57■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 KCNH8Q96L42 1107 aa20.55■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.54■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.54■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.53■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 AKNAQ7Z591 1439 aa20.53■□□□□ 0.88
CNN2-201ENST00000263097 KIF14Q15058 1648 aa20.51■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.5■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 NEFLP07196 543 aa20.49■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.49■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.49■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.48■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 ABCC5O15440 1437 aa20.48■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 DAPK1P53355 1430 aa20.48■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.48■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.46■□□□□ 0.87
CNN2-201ENST00000263097 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.45■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 ROCK1Q13464 1354 aa20.44■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.43■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.43■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 FKBP8Q14318 412 aa20.42■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 KDM6BO15054 1643 aa20.42■□□□□ 0.86
CNN2-201ENST00000263097 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CNN2-201ENST00000263097 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.36■□□□□ 0.85
CNN2-201ENST00000263097 ABCC2Q92887 1545 aa20.36■□□□□ 0.85
CNN2-201ENST00000263097 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CNN2-201ENST00000263097 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CNN2-201ENST00000263097 NCOA1Q15788 1441 aa20.31■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.31■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 ADGRL2O95490 1459 aa20.3■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 TRIM52Q96A61 297 aa20.29■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.28■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.28■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 BCANQ96GW7 911 aa20.28■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.28■□□□□ 0.84
CNN2-201ENST00000263097 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.25■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.836e-8■■■□□ 18.5
CNN2-201ENST00000263097 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.24■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.24■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 MBD5Q9P267 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.23■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 8.3
CNN2-201ENST00000263097 PREX2Q70Z35 1606 aa20.23■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.23■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.22■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.21■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.21■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.21■□□□□ 0.83
CNN2-201ENST00000263097 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.2■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.19■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 PZPP20742 1482 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 FOXD1Q16676 465 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.825e-9■■□□□ 11.7
CNN2-201ENST00000263097 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNN2-201ENST00000263097 TSPY4P0CV99 314 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 TSPY10P0CW01 314 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 CCDC7Q96M83 1385 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.11■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 OSCARQ8IYS5 282 aa20.1■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 PLCH2O75038 1416 aa20.1■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.1■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.09■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.09■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 KIF15Q9NS87 1388 aa20.09■□□□□ 0.81
CNN2-201ENST00000263097 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.07■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.06■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.06■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.05■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.04■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.03■□□□□ 0.8
CNN2-201ENST00000263097 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.02■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 NUP155O75694 1391 aa20.01■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.01■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.01■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 PKD2Q13563 968 aa20.01■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 PPP4R2Q9NY27 417 aa20■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.99■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 ABCC1P33527 1531 aa19.98■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.97■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 MRS2Q9HD23 443 aa19.96■□□□□ 0.79
CNN2-201ENST00000263097 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms