RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 NAIPQ13075 1403 aa31.27■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 ABCC5O15440 1437 aa31.26■■■□□ 2.59
RFXAP-201ENST00000255476 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.24■■■□□ 2.59
RFXAP-201ENST00000255476 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.23■■■□□ 2.59
RFXAP-201ENST00000255476 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.21■■■□□ 2.59
RFXAP-201ENST00000255476 PREX2Q70Z35 1606 aa31.17■■■□□ 2.58
RFXAP-201ENST00000255476 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.17■■■□□ 2.58
RFXAP-201ENST00000255476 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.16■■■□□ 2.58
RFXAP-201ENST00000255476 MAPKBP1O60336 1514 aa31.13■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 AKNAQ7Z591 1439 aa31.12■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 KDM6BO15054 1643 aa31.11■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.11■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.09■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.09■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.08■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 ROCK1Q13464 1354 aa31.08■■■□□ 2.57
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
RFXAP-201ENST00000255476 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.06■■■□□ 2.56
RFXAP-201ENST00000255476 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
RFXAP-201ENST00000255476 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.02■■■□□ 2.56
RFXAP-201ENST00000255476 ASXL2Q76L83 1435 aa31.01■■■□□ 2.56
RFXAP-201ENST00000255476 MBD5Q9P267 1494 aa31.01■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 NCOA1Q15788 1441 aa31■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 PLCH2O75038 1416 aa30.99■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.97■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.96■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 ADGRL2O95490 1459 aa30.95■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.95■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM52Q96A61 297 aa30.95■■■□□ 2.55
RFXAP-201ENST00000255476 TSPY4P0CV99 314 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 TSPY10P0CW01 314 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.93■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.92■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.92■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.91■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.9■■■□□ 2.54
RFXAP-201ENST00000255476 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.88■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.87■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 NEUROD1Q13562 356 aa30.87■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.84■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.84■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.84■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
RFXAP-201ENST00000255476 ABCC1P33527 1531 aa30.8■■■□□ 2.52
RFXAP-201ENST00000255476 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.8■■■□□ 2.52
RFXAP-201ENST00000255476 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.8■■■□□ 2.52
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.79■■■□□ 2.52
RFXAP-201ENST00000255476 KIF15Q9NS87 1388 aa30.78■■■□□ 2.52
RFXAP-201ENST00000255476 FANCAO15360 1455 aa30.76■■■□□ 2.51
RFXAP-201ENST00000255476 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.75■■■□□ 2.51
RFXAP-201ENST00000255476 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.73■■■□□ 2.51
RFXAP-201ENST00000255476 FOXD1Q16676 465 aa30.73■■■□□ 2.51
RFXAP-201ENST00000255476 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
RFXAP-201ENST00000255476 AFAP1Q8N556 730 aa30.68■■■□□ 2.5
RFXAP-201ENST00000255476 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
RFXAP-201ENST00000255476 PZPP20742 1482 aa30.67■■■□□ 2.5
RFXAP-201ENST00000255476 CD109Q6YHK3 1445 aa30.65■■■□□ 2.5
RFXAP-201ENST00000255476 ADGRL1O94910 1474 aa30.63■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 PLXNC1O60486 1568 aa30.63■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.61■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 NUP155O75694 1391 aa30.59■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
RFXAP-201ENST00000255476 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.57■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 TONSLQ96HA7 1378 aa30.57■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.55■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.54■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.53■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 PKD2Q13563 968 aa30.52■■■□□ 2.48
RFXAP-201ENST00000255476 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.5■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.49■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.47■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 ATP7AQ04656 1500 aa30.47■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.47■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.472e-7■■■□□ 16.3
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.45■■■□□ 2.47
RFXAP-201ENST00000255476 ERBINQ96RT1 1412 aa30.45■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 UNC13BO14795 1591 aa30.44■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.43■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.41■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 GLI2P10070 1586 aa30.4■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.4■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 DIP2BQ9P265 1576 aa30.4■■■□□ 2.46
RFXAP-201ENST00000255476 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.38■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.37■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 NEO1Q92859 1461 aa30.37■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.34■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 RAPGEF3O95398 923 aa30.33■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.33■■■□□ 2.45
RFXAP-201ENST00000255476 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.32■■■□□ 2.44
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