RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.98■■□□□ 1.75
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA3Q08378 1498 aa25.98■■□□□ 1.75
ZBED3-201ENST00000255198 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ZBED3-201ENST00000255198 KANK1Q14678 1352 aa25.93■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.92■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ZBED3-201ENST00000255198 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.89■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.87■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 GORABQ5T7V8 394 aa25.86■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 GGT6Q6P531 493 aa25.86■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.84■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 ERCC6Q03468 1493 aa25.83■■□□□ 1.73
ZBED3-201ENST00000255198 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.81■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 G3V3G9 751 aa25.78■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.78■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP44Q96MT7 982 aa25.78■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.78■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 GBP4Q96PP9 640 aa25.77■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.77■■□□□ 1.72
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.75■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD1Q16676 465 aa25.73■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 TPM4P67936 248 aa25.73■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 VPS53Q5VIR6 699 aa25.72■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 KIF27Q86VH2 1401 aa25.72■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ZBED3-201ENST00000255198 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.7■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 TOMM22Q9NS69 142 aa25.69■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 STK31Q9BXU1 1019 aa25.68■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 GPATCH3Q96I76 525 aa25.67■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
ZBED3-201ENST00000255198 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.64■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.63■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 PTMSP20962 102 aa25.62■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 PKD2Q13563 968 aa25.62■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 EEA1Q15075 1411 aa25.62■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.62■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 MARCH6O60337 910 aa25.61■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.6■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.6■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 WWC1Q8IX03 1113 aa25.6■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.58■■□□□ 1.69
ZBED3-201ENST00000255198 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.58■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 CEP89Q96ST8 783 aa25.57■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.56■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2FA1L443 756 aa25.55■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 FBXO3Q9UK99 471 aa25.55■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.53■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.53■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.52■■□□□ 1.68
ZBED3-201ENST00000255198 HMMRO75330 724 aa25.51■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 TPM3P06753 285 aa25.49■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 AMPHP49418 695 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 CCER2I3L3R5 266 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 RAD21O60216 631 aa25.45■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 KIF16BQ96L93 1317 aa25.45■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.43■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 MSH5O43196 834 aa25.43■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 RALBP1Q15311 655 aa25.41■■□□□ 1.66
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