RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.14■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LRP3-201ENST00000253193 TMC1Q8TDI8 760 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP3-201ENST00000253193 CCDC7Q96M83 1385 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP3-201ENST00000253193 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
LRP3-201ENST00000253193 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.08■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.08■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.07■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 MIA2Q96PC5 1412 aa25.06■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.06■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 IQGAP2Q13576 1575 aa25.05■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 HECW1Q76N89 1606 aa25.05■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.05■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 RGL3Q3MIN7 710 aa25.03■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 SAMD9Q5K651 1589 aa25.03■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.02■■□□□ 1.6
LRP3-201ENST00000253193 DAPK1P53355 1430 aa25.01■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 JPH4Q96JJ6 628 aa25.01■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 DCAF11Q8TEB1 546 aa25■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 ERCC6Q03468 1493 aa25■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 NUP155O75694 1391 aa24.99■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.99■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 ABCC5O15440 1437 aa24.97■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
LRP3-201ENST00000253193 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.95■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 USP47Q96K76 1375 aa24.92■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.91■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.91■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 KDM6BO15054 1643 aa24.9■■□□□ 1.58
LRP3-201ENST00000253193 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.88■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.88■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 ROCK1Q13464 1354 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 NCOA1Q15788 1441 aa24.86■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.86■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 AKNAQ7Z591 1439 aa24.85■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.84■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.83■■□□□ 1.57
LRP3-201ENST00000253193 IFT140Q96RY7 1462 aa24.83■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.82■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 WDR62O43379 1518 aa24.81■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.81■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF11O15085 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS12P58397 1594 aa24.77■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 NUDCQ9Y266 331 aa24.77■■□□□ 1.56
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.76■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 GRIN2AQ12879 1464 aa24.75■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.74■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 DISP1Q96F81 1524 aa24.71■■□□□ 1.55
LRP3-201ENST00000253193 NBR1Q14596 966 aa24.7■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 PBRM1Q86U86 1689 aa24.7■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 KIF15Q9NS87 1388 aa24.68■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.67■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.65■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 KIAA0556O60303 1618 aa24.64■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
LRP3-201ENST00000253193 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.63■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.63■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 PZPP20742 1482 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 RALBP1Q15311 655 aa24.61■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.61■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 PTPRGP23470 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.58■■□□□ 1.53
LRP3-201ENST00000253193 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.55■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.54■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 NLRP13Q86W25 1043 aa24.54■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 SYNJ2O15056 1496 aa24.53■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LRP3-201ENST00000253193 PANK3Q9H999 370 aa24.5■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.5■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms