RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.56■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC184Q52MB2 194 aa25.55■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 KIAA0556O60303 1618 aa25.54■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.54■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 NEFLP07196 543 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 FBLN2P98095 1184 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 GRIN2AQ12879 1464 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PRDM12-201ENST00000253008 ROCK1Q13464 1354 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC7Q96M83 1385 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM12-201ENST00000253008 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.39■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 NCOA1Q15788 1441 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 CEP170Q5SW79 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 PZPP20742 1482 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 KIF14Q15058 1648 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PRDM12-201ENST00000253008 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.33■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 JPH4Q96JJ6 628 aa25.3■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.3■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 PKD2Q13563 968 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 MRS2Q9HD23 443 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM12-201ENST00000253008 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM12-201ENST00000253008 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PRDM12-201ENST00000253008 SYNJ2O15056 1496 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM12-201ENST00000253008 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM12-201ENST00000253008 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.17■■□□□ 1.62
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PRDM12-201ENST00000253008 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM12-201ENST00000253008 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 NUP160Q12769 1436 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ADGRL2O95490 1459 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 MBD5Q9P267 1494 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 USP47Q96K76 1375 aa25.13■■□□□ 1.61
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PRDM12-201ENST00000253008 NUP155O75694 1391 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ATP10BO94823 1461 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRDM12-201ENST00000253008 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 ABCA8O94911 1581 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 TSPY4P0CV99 314 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 TSPY10P0CW01 314 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM12-201ENST00000253008 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRDM12-201ENST00000253008 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM12-201ENST00000253008 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM12-201ENST00000253008 KIF15Q9NS87 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM12-201ENST00000253008 KDM5CP41229 1560 aa24.98■■□□□ 1.59
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PRDM12-201ENST00000253008 MSH5O43196 834 aa24.95■■□□□ 1.58
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PRDM12-201ENST00000253008 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM12-201ENST00000253008 PTPRGP23470 1445 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM12-201ENST00000253008 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.92■■□□□ 1.58
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PRDM12-201ENST00000253008 CHD1O14646 1710 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM12-201ENST00000253008 RGL3Q3MIN7 710 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.85■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 TMC1Q8TDI8 760 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.83■■□□□ 1.57
PRDM12-201ENST00000253008 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.83■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.81■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.8■■□□□ 1.56
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