RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 OSCARQ8IYS5 282 aa28.93■■■□□ 2.22
VGF-201ENST00000249330 HFM1A2PYH4 1435 aa28.93■■■□□ 2.22
VGF-201ENST00000249330 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.93■■■□□ 2.22
VGF-201ENST00000249330 NAIPQ13075 1403 aa28.91■■■□□ 2.22
VGF-201ENST00000249330 ABCC2Q92887 1545 aa28.9■■■□□ 2.22
VGF-201ENST00000249330 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.86■■■□□ 2.21
VGF-201ENST00000249330 MAPKBP1O60336 1514 aa28.85■■■□□ 2.21
VGF-201ENST00000249330 DAPK1P53355 1430 aa28.85■■■□□ 2.21
VGF-201ENST00000249330 ABCC5O15440 1437 aa28.84■■■□□ 2.21
VGF-201ENST00000249330 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.83■■■□□ 2.21
VGF-201ENST00000249330 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.82■■■□□ 2.2
VGF-201ENST00000249330 KCNH8Q96L42 1107 aa28.81■■■□□ 2.2
VGF-201ENST00000249330 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.8■■■□□ 2.2
VGF-201ENST00000249330 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
VGF-201ENST00000249330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.75■■■□□ 2.19
VGF-201ENST00000249330 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.75■■■□□ 2.19
VGF-201ENST00000249330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
VGF-201ENST00000249330 KDM6BO15054 1643 aa28.73■■■□□ 2.19
VGF-201ENST00000249330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.72■■■□□ 2.19
VGF-201ENST00000249330 AKNAQ7Z591 1439 aa28.69■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 TRIM52Q96A61 297 aa28.68■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.67■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 ROCK1Q13464 1354 aa28.67■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.66■■■□□ 2.18
VGF-201ENST00000249330 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.63■■■□□ 2.17
VGF-201ENST00000249330 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.61■■■□□ 2.17
VGF-201ENST00000249330 NCOA1Q15788 1441 aa28.61■■■□□ 2.17
VGF-201ENST00000249330 PREX2Q70Z35 1606 aa28.59■■■□□ 2.17
VGF-201ENST00000249330 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.57■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.56■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 TSPY4P0CV99 314 aa28.56■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 TSPY10P0CW01 314 aa28.56■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 MBD5Q9P267 1494 aa28.55■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.54■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.53■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.52■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.52■■■□□ 2.16
VGF-201ENST00000249330 FOXD1Q16676 465 aa28.51■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 ADGRL2O95490 1459 aa28.51■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.49■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.48■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 PLCH2O75038 1416 aa28.48■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.48■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.47■■■□□ 2.15
VGF-201ENST00000249330 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.44■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.44■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 ASXL2Q76L83 1435 aa28.44■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.44■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.43■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.42■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.42■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.4■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
VGF-201ENST00000249330 KIF15Q9NS87 1388 aa28.38■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.37■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.37■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.36■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 TONSLQ96HA7 1378 aa28.36■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.34■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 BCANQ96GW7 911 aa28.33■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 FKBP8Q14318 412 aa28.33■■■□□ 2.13
VGF-201ENST00000249330 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.32■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 PZPP20742 1482 aa28.31■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.29■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 AFAP1Q8N556 730 aa28.28■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 NUP155O75694 1391 aa28.27■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.27■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 ABCC1P33527 1531 aa28.27■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.26■■■□□ 2.12
VGF-201ENST00000249330 FANCAO15360 1455 aa28.25■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 NEFLP07196 543 aa28.25■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 PKD2Q13563 968 aa28.24■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 CCER2I3L3R5 266 aa28.23■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.21■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.21■■■□□ 2.11
VGF-201ENST00000249330 ANP32CO43423 234 aa28.19■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.17■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.17■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.17■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.15■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
VGF-201ENST00000249330 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.14■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 ADGRL1O94910 1474 aa28.13■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 CD109Q6YHK3 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 PLXNC1O60486 1568 aa28.12■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.09■■■□□ 2.09
VGF-201ENST00000249330 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.07■■■□□ 2.08
VGF-201ENST00000249330 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.07■■■□□ 2.08
VGF-201ENST00000249330 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.04■■■□□ 2.08
VGF-201ENST00000249330 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.03■■■□□ 2.08
VGF-201ENST00000249330 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.03■■■□□ 2.08
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