RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 ROCK1Q13464 1354 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 NEUROD1Q13562 356 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 KDM6BO15054 1643 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC11-201ENST00000243082 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC2Q92887 1545 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC11-201ENST00000243082 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM52Q96A61 297 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC11-201ENST00000243082 NCOA1Q15788 1441 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 ADGRL2O95490 1459 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 TONSLQ96HA7 1378 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC11-201ENST00000243082 PREX2Q70Z35 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 MIER1Q8N108 512 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
HOXC11-201ENST00000243082 MBD5Q9P267 1494 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 FOXD1Q16676 465 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 TSPY4P0CV99 314 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 TSPY10P0CW01 314 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 PZPP20742 1482 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 KCNH8Q96L42 1107 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC11-201ENST00000243082 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 KIF15Q9NS87 1388 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 PLCH2O75038 1416 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 OSCARQ8IYS5 282 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC11-201ENST00000243082 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.39■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 NUP155O75694 1391 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXC11-201ENST00000243082 PKD2Q13563 968 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC11-201ENST00000243082 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC11-201ENST00000243082 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC11-201ENST00000243082 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC11-201ENST00000243082 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXC11-201ENST00000243082 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC1P33527 1531 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 PLXNC1O60486 1568 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXC11-201ENST00000243082 ASXL2Q76L83 1435 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 UNC13BO14795 1591 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXC11-201ENST00000243082 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 ERBINQ96RT1 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 FANCAO15360 1455 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 AFAP1Q8N556 730 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXC11-201ENST00000243082 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXC11-201ENST00000243082 ADGRL1O94910 1474 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 SCAPERQ9BY12 1400 aa26■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 PLA2R1Q13018 1463 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 ATP7AQ04656 1500 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXC11-201ENST00000243082 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXC11-201ENST00000243082 ANP32CO43423 234 aa25.93■■□□□ 1.74
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