RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 GPS2Q13227 327 aa14.86□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 KIF3AQ9Y496 699 aa14.86□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.85□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.83□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 CLIP1P30622 1438 aa14.83□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TMF1P82094 1093 aa14.82□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 KANK1Q14678 1352 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 SCRIBQ14160 1630 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TPM2P07951 284 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 KCNH8Q96L42 1107 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TPM1P09493 284 aa14.79□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 GORABQ5T7V8 394 aa14.79□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 PDE4CQ08493 712 aa14.78□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 ARID3AQ99856 593 aa14.77□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 G3V3G9 751 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 HMMRO75330 724 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 MARCH6O60337 910 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 KIF16BQ96L93 1317 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 MORC1Q86VD1 984 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 TEX35Q5T0J7 233 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 ST18O60284 1047 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 EEA1Q15075 1411 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 GOLGA3Q08378 1498 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 VPS53Q5VIR6 699 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 CDR1P51861 262 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 STK31Q9BXU1 1019 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.68□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 APBB1O00213 710 aa14.68□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.68□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.68□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.67□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.67□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.66□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 H3BQV1 296 aa14.65□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 IFFO2Q5TF58 517 aa14.65□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 CCER2I3L3R5 266 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 BECN2A8MW95 431 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 AK7Q96M32 723 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 SOX12O15370 315 aa14.62□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.61□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RUFY1Q96T51 708 aa14.61□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.61□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCTN1Q14203 1278 aa14.58□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms