RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.35■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 ATP10BO94823 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 TONSLQ96HA7 1378 aa28.34■■■□□ 2.13
RTKN-201ENST00000233330 SHROOM2Q13796 1616 aa28.31■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.29■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.28■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 PTPRGP23470 1445 aa28.28■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.27■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 TRIM52Q96A61 297 aa28.27■■■□□ 2.12
RTKN-201ENST00000233330 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.26■■■□□ 2.11
RTKN-201ENST00000233330 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.26■■■□□ 2.11
RTKN-201ENST00000233330 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RTKN-201ENST00000233330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.24■■■□□ 2.11
RTKN-201ENST00000233330 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.22■■■□□ 2.11
RTKN-201ENST00000233330 ADGRL2O95490 1459 aa28.19■■■□□ 2.1
RTKN-201ENST00000233330 NCOA1Q15788 1441 aa28.17■■■□□ 2.1
RTKN-201ENST00000233330 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
RTKN-201ENST00000233330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
RTKN-201ENST00000233330 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.09■■■□□ 2.09
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.07■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.06■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.06■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 PREX2Q70Z35 1606 aa28.06■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.05■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 FOXD1Q16676 465 aa28.05■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 ABCC2Q92887 1545 aa28.04■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 PZPP20742 1482 aa28.04■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.03■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.02■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RTKN-201ENST00000233330 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.01■■■□□ 2.07
RTKN-201ENST00000233330 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.99■■■□□ 2.07
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.98■■■□□ 2.07
RTKN-201ENST00000233330 MBD5Q9P267 1494 aa27.96■■■□□ 2.07
RTKN-201ENST00000233330 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.95■■■□□ 2.07
RTKN-201ENST00000233330 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.94■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.94■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 TSPY4P0CV99 314 aa27.91■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 TSPY10P0CW01 314 aa27.91■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.9■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.89■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.89■■■□□ 2.06
RTKN-201ENST00000233330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.87■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.86■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.85■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 KIF15Q9NS87 1388 aa27.85■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.84■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.83■■■□□ 2.05
RTKN-201ENST00000233330 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.81■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 PKD2Q13563 968 aa27.8■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 NUP155O75694 1391 aa27.79■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 KCNH8Q96L42 1107 aa27.78■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.76■■■□□ 2.04
RTKN-201ENST00000233330 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.75■■■□□ 2.03
RTKN-201ENST00000233330 ANP32CO43423 234 aa27.73■■■□□ 2.03
RTKN-201ENST00000233330 PLXNC1O60486 1568 aa27.71■■■□□ 2.03
RTKN-201ENST00000233330 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.7■■■□□ 2.03
RTKN-201ENST00000233330 PLCH2O75038 1416 aa27.7■■■□□ 2.03
RTKN-201ENST00000233330 CCER2I3L3R5 266 aa27.69■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.66■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 UNC13BO14795 1591 aa27.66■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.66■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.65■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
RTKN-201ENST00000233330 ABCC1P33527 1531 aa27.63■■■□□ 2.01
RTKN-201ENST00000233330 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.59■■■□□ 2.01
RTKN-201ENST00000233330 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.59■■■□□ 2.01
RTKN-201ENST00000233330 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.58■■■□□ 2.01
RTKN-201ENST00000233330 CCDC7Q96M83 1385 aa27.57■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.56■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.55■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.55■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.54■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 ERBINQ96RT1 1412 aa27.52■■■□□ 2
RTKN-201ENST00000233330 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.51■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.51■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.5■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 KDM5CP41229 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.47■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 USP47Q96K76 1375 aa27.46■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.45■■□□□ 1.99
RTKN-201ENST00000233330 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.43■■□□□ 1.98
RTKN-201ENST00000233330 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.43■■□□□ 1.98
RTKN-201ENST00000233330 PLA2R1Q13018 1463 aa27.43■■□□□ 1.98
RTKN-201ENST00000233330 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.982e-9■■□□□ 11.4
RTKN-201ENST00000233330 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms