RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.66■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 ROCK1Q13464 1354 aa27.65■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.64■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.64■■■□□ 2.01
UTP18-201ENST00000225298 ABCC5O15440 1437 aa27.63■■■□□ 2.01
UTP18-201ENST00000225298 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
UTP18-201ENST00000225298 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.61■■■□□ 2.01
UTP18-201ENST00000225298 MAPKBP1O60336 1514 aa27.55■■■□□ 2
UTP18-201ENST00000225298 KCNH8Q96L42 1107 aa27.54■■■□□ 2
UTP18-201ENST00000225298 PREX2Q70Z35 1606 aa27.54■■■□□ 2
UTP18-201ENST00000225298 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.52■■■□□ 2
UTP18-201ENST00000225298 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
UTP18-201ENST00000225298 TSPY4P0CV99 314 aa27.51■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 TSPY10P0CW01 314 aa27.51■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.49■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.48■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 TRIM52Q96A61 297 aa27.48■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.47■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.47■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.47■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.46■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.46■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 ADGRL2O95490 1459 aa27.46■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.46■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.45■■□□□ 1.99
UTP18-201ENST00000225298 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.45■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.44■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 NCOA1Q15788 1441 aa27.44■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.42■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 PLCH2O75038 1416 aa27.41■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.4■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.4■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.4■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.39■■□□□ 1.98
UTP18-201ENST00000225298 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 NEUROD1Q13562 356 aa27.37■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 MBD5Q9P267 1494 aa27.37■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.37■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 KDM6BO15054 1643 aa27.35■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.34■■□□□ 1.97
UTP18-201ENST00000225298 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.32■■□□□ 1.96
UTP18-201ENST00000225298 ASXL2Q76L83 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
UTP18-201ENST00000225298 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.32■■□□□ 1.96
UTP18-201ENST00000225298 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.31■■□□□ 1.96
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.29■■□□□ 1.96
UTP18-201ENST00000225298 KIF15Q9NS87 1388 aa27.25■■□□□ 1.95
UTP18-201ENST00000225298 TONSLQ96HA7 1378 aa27.25■■□□□ 1.95
UTP18-201ENST00000225298 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.24■■□□□ 1.95
UTP18-201ENST00000225298 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.24■■□□□ 1.95
UTP18-201ENST00000225298 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
UTP18-201ENST00000225298 ABCC1P33527 1531 aa27.19■■□□□ 1.94
UTP18-201ENST00000225298 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
UTP18-201ENST00000225298 FANCAO15360 1455 aa27.16■■□□□ 1.94
UTP18-201ENST00000225298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
UTP18-201ENST00000225298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.14■■□□□ 1.94
UTP18-201ENST00000225298 PLXNC1O60486 1568 aa27.13■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 NUP155O75694 1391 aa27.11■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 PZPP20742 1482 aa27.11■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.1■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.08■■□□□ 1.93
UTP18-201ENST00000225298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.07■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.07■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.07■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 FOXD1Q16676 465 aa27.06■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 CD109Q6YHK3 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 ADGRL1O94910 1474 aa27.06■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 PKD2Q13563 968 aa27.04■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 ERBINQ96RT1 1412 aa27.03■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.02■■□□□ 1.92
UTP18-201ENST00000225298 AFAP1Q8N556 730 aa27.01■■□□□ 1.91
UTP18-201ENST00000225298 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
UTP18-201ENST00000225298 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.98■■□□□ 1.91
UTP18-201ENST00000225298 UNC13BO14795 1591 aa26.95■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.94■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 ATP7AQ04656 1500 aa26.92■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.92■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.92■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.95e-9■■■□□ 16.8
UTP18-201ENST00000225298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
UTP18-201ENST00000225298 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.89■■□□□ 1.89
UTP18-201ENST00000225298 NEO1Q92859 1461 aa26.89■■□□□ 1.89
UTP18-201ENST00000225298 GLI2P10070 1586 aa26.85■■□□□ 1.89
UTP18-201ENST00000225298 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.85■■□□□ 1.89
UTP18-201ENST00000225298 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.84■■□□□ 1.89
UTP18-201ENST00000225298 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.81■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.8■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.79■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 KANK1Q14678 1352 aa26.79■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.76■■□□□ 1.88
UTP18-201ENST00000225298 KDM5CP41229 1560 aa26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms