RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 ROCK1Q13464 1354 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM6BO15054 1643 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-201ENST00000216840 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-201ENST00000216840 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 PREX2Q70Z35 1606 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 NEUROD1Q13562 356 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRL2O95490 1459 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-201ENST00000216840 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 NCOA1Q15788 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM52Q96A61 297 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 MBD5Q9P267 1494 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 OSCARQ8IYS5 282 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNH8Q96L42 1107 aa24.89■■□□□ 1.58
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TONSLQ96HA7 1378 aa24.87■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.87■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPY4P0CV99 314 aa24.86■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPY10P0CW01 314 aa24.86■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.84■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.84■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.83■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PLCH2O75038 1416 aa24.83■■□□□ 1.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PZPP20742 1482 aa24.82■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.8■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD1Q16676 465 aa24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF15Q9NS87 1388 aa24.77■■□□□ 1.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-201ENST00000216840 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC1P33527 1531 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 PLXNC1O60486 1568 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ASXL2Q76L83 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 MIER1Q8N108 512 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 NUP155O75694 1391 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-201ENST00000216840 PKD2Q13563 968 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 UNC13BO14795 1591 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-201ENST00000216840 FANCAO15360 1455 aa24.58■■□□□ 1.52
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.55■■□□□ 1.52
RABGGTA-201ENST00000216840 ERBINQ96RT1 1412 aa24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-201ENST00000216840 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-201ENST00000216840 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 AFAP1Q8N556 730 aa24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRL1O94910 1474 aa24.48■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.48■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.45■■□□□ 1.51
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.45■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP7AQ04656 1500 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.51e-6■■□□□ 13.5
RABGGTA-201ENST00000216840 CD109Q6YHK3 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.4■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.39■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.39■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.39■■□□□ 1.5
RABGGTA-201ENST00000216840 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-201ENST00000216840 PLA2R1Q13018 1463 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-201ENST00000216840 DEPDC5O75140 1603 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-201ENST00000216840 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-201ENST00000216840 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.33■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.33■■□□□ 1.48
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