RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANP32CO43423 234 aa31.14■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUP160Q12769 1436 aa31.06■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.05■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.03■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.03■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.02■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.02■■■□□ 2.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 JPH4Q96JJ6 628 aa31■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.99■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.98■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FOXD1Q16676 465 aa30.97■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FBLN2P98095 1184 aa30.96■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF14Q15058 1648 aa30.94■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.92■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.91■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NCOA1Q15788 1441 aa30.91■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGRL2O95490 1459 aa30.89■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.88■■■□□ 2.53
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.87■■■□□ 2.53
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCA8O94911 1581 aa30.87■■■□□ 2.53
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PZPP20742 1482 aa30.85■■■□□ 2.53
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.79■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.79■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP10BO94823 1461 aa30.79■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.78■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.78■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.78■■■□□ 2.52
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.75■■■□□ 2.51
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.73■■■□□ 2.51
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC7Q96M83 1385 aa30.72■■■□□ 2.51
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.71■■■□□ 2.51
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.71■■■□□ 2.51
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.69■■■□□ 2.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FKBP8Q14318 412 aa30.68■■■□□ 2.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MBD5Q9P267 1494 aa30.65■■■□□ 2.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.63■■■□□ 2.49
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PKD2Q13563 968 aa30.62■■■□□ 2.49
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEFLP07196 543 aa30.61■■■□□ 2.49
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTPRGP23470 1445 aa30.6■■■□□ 2.49
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.57■■■□□ 2.49
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.56■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.56■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSPY4P0CV99 314 aa30.55■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSPY10P0CW01 314 aa30.55■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BCANQ96GW7 911 aa30.54■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.53■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUP155O75694 1391 aa30.53■■■□□ 2.48
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF15Q9NS87 1388 aa30.47■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.47■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.47■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PREX2Q70Z35 1606 aa30.47■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC184Q52MB2 194 aa30.46■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHD1O14646 1710 aa30.46■■■□□ 2.47
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.45■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP47Q96K76 1375 aa30.44■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.43■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.43■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.43■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SHROOM2Q13796 1616 aa30.43■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM5CP41229 1560 aa30.41■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.4■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.39■■■□□ 2.46
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MRS2Q9HD23 443 aa30.37■■■□□ 2.45
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.31■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.3■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.3■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.29■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.27■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYT1Q01538 1121 aa30.27■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCC2Q92887 1545 aa30.27■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.26■■■□□ 2.44
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.26■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.25■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UNC13BO14795 1591 aa30.22■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.22■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.22■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.21■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.2■■■□□ 2.43
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLXNC1O60486 1568 aa30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms