RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.48■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.48■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.48■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.47■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 PLIN1O60240 522 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 NUDCQ9Y266 331 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 GRIN2BQ13224 1484 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 NCOA1Q15788 1441 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 USP47Q96K76 1375 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.35■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC4A3P48751 1232 aa23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCC5O15440 1437 aa23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 DAPK1P53355 1430 aa23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 NUP155O75694 1391 aa23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 PRDM2Q13029 1718 aa23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CUL7Q14999 1698 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 IL27Q8NEV9 243 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 NEFMP07197 916 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPY4P0CV99 314 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPY10P0CW01 314 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SAMD9Q5K651 1589 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE4AP27815 886 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.1■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CRBNQ96SW2 442 aa23.08■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS3P49796 1198 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 HECW1Q76N89 1606 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 MIA2Q96PC5 1412 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 PANK3Q9H999 370 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 PZPP20742 1482 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.02■■□□□ 1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 IQGAP2Q13576 1575 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGEF11O15085 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF15Q9NS87 1388 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.98■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 NLRP13Q86W25 1043 aa22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 JPH4Q96JJ6 628 aa22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 ARXQ96QS3 562 aa22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR62O43379 1518 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 ROCK1Q13464 1354 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 RALBP1Q15311 655 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms