RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 PTPRKQ15262 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 CFTRP13569 1480 aa22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 NEUROD2Q15784 382 aa22.2■■□□□ 1.15
NFE2L3-201ENST00000056233 CRBNQ96SW2 442 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 NAIPQ13075 1403 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 USP47Q96K76 1375 aa22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 TSPY4P0CV99 314 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 TSPY10P0CW01 314 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 NCOA2Q15596 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
NFE2L3-201ENST00000056233 HFM1A2PYH4 1435 aa22.14■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.09■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.08■■□□□ 1.13
NFE2L3-201ENST00000056233 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 GSE1Q14687 1217 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 NUP155O75694 1391 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 NFKBIBQ15653 356 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 NLRP13Q86W25 1043 aa22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3-201ENST00000056233 BACH2Q9BYV9 841 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 RALBP1Q15311 655 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 PANK3Q9H999 370 aa21.97■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.96■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF15Q9NS87 1388 aa21.95■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 NCOA1Q15788 1441 aa21.95■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.93■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.93■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 NCAPD3P42695 1498 aa21.92■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.91■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.91■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 USP35Q9P2H5 1018 aa21.91■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.9■■□□□ 1.1
NFE2L3-201ENST00000056233 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 NESP48681 1621 aa21.87■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.87■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 BECN1Q14457 450 aa21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 TMF1P82094 1093 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM161AQ3B820 660 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 MS4A1P11836 297 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 MAP3K1Q13233 1512 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3-201ENST00000056233 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 PDE3BQ13370 1112 aa21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA2Q08379 1002 aa21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 COG6Q9Y2V7 657 aa21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 APAF1O14727 1248 aa21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NFE2L3-201ENST00000056233 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.76■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 BCAR3O75815 825 aa21.76■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.74■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 PANK1Q8TE04 598 aa21.73■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.73■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.72■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 POGKQ9P215 609 aa21.72■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
NFE2L3-201ENST00000056233 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 ARID3AQ99856 593 aa21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 DAPK1P53355 1430 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms