RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000223804.1

Tdp2-203, Transcript of Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2, mousemouse

BASIC

Gene Tdp2, Length 1,136 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Synj2Q9D2G5 1434 aa41,38■■■■■ 4,22
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Prex2Q3LAC4 1598 aa41,33■■■■■ 4,21
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Setd5Q5XJV7 1441 aa41,28■■■■■ 4,2
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Hecw2Q6I6G8 1578 aa41,27■■■■■ 4,2
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP41,25■■■■■ 4,19
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ncoa3O09000 1398 aa41,23■■■■■ 4,19
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Abca9Q8K449 1623 aa41,21■■■■■ 4,19
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa41,2■■■■■ 4,19
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa41,18■■■■■ 4,18
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kiaa0556Q8C753 1610 aa41,16■■■■■ 4,18
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP41,14■■■■■ 4,18
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Mug1P28665 1476 aa41,12■■■■■ 4,17
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa41,1■■■■■ 4,17
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP41,09■■■■■ 4,17
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP41,07■■■■■ 4,17
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Erich3F6QRE9 1637 aa41,05■■■■■ 4,16
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Lemd3Q9WU40 921 aa41,05■■■■■ 4,16
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Qser1A2BIE1 1698 aa41,04■■■■■ 4,16
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Eea1Q8BL66 1411 aa41,03■■■■■ 4,16
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa40,98■■■■■ 4,15
Tdp2-203ENSMUST00000223804 PtprmP28828 1452 aa40,97■■■■■ 4,15
Tdp2-203ENSMUST00000223804 OvosQ3UU35 1456 aa40,97■■■■■ 4,15
Tdp2-203ENSMUST00000223804 MyclP10166 368 aa40,94■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Pcf11G3X9Z4 1553 aa40,94■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Atp10aO54827 1508 aa40,93■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa40,93■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 NpatQ8BMA5 1420 aa40,92■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Camsap2Q8C1B1 1461 aa40,91■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP40,91■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Arhgap5P97393 1501 aa40,91■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Neurl4Q5NCX5 1563 aa40,89■■■■■ 4,14
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa40,87■■■■■ 4,13
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Yeats2Q3TUF7 1407 aa40,86■■■■■ 4,13
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ptch1Q61115 1434 aa40,83■■■■■ 4,13
Tdp2-203ENSMUST00000223804 CntlnA2AM05 1397 aa40,81■■■■■ 4,12
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP40,74■■■■■ 4,11
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Dip2cE9PWR4 1557 aa40,7■■■■■ 4,11
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kdm5cP41230 1554 aa40,7■■■■■ 4,11
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Lmod2Q3UHZ5 550 aa40,69■■■■■ 4,1
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kidins220E9Q9B7 1793 aa40,69■■■■■ 4,1
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cul9Q80TT8 1865 aa40,66■■■■■ 4,1
Tdp2-203ENSMUST00000223804 RereQ80TZ9 1558 aa40,65■■■■■ 4,1
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP40,6■■■■■ 4,09
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Trappc8E9PWG2 1437 aa40,59■■■■■ 4,09
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa40,58■■■■■ 4,09
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Fbxo41Q6NS60 873 aa40,57■■■■■ 4,09
Tdp2-203ENSMUST00000223804 NexmifQ5DTT1 1515 aa40,54■■■■■ 4,08
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Tdrd9Q14BI7 1383 aa40,54■■■■■ 4,08
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Abcc3B2RX12 1523 aa40,52■■■■■ 4,08
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cfap74Q3UY96 1578 aa40,5■■■■■ 4,07
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP40,5■■■■■ 4,07
Tdp2-203ENSMUST00000223804 SphkapQ6NSW3 1687 aa40,48■■■■■ 4,07
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP40,45■■■■■ 4,07
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP40,42■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa40,42■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa40,42■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Peg3Q3URU2 1571 aa40,41■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Talpid3E9PV87 1520 aa40,41■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cfap65Q3V0B4 1847 aa40,4■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Tiam1Q60610 1591 aa40,4■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Caskin1Q6P9K8 1431 aa40,39■■■■■ 4,06
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Naip1Q9QWK5 1403 aa40,32■■■■■ 4,04
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Afap1Q80YS6 731 aa40,31■■■■■ 4,04
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Myom2Q14BI5 1463 aa40,26■■■■■ 4,04
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Adcy10Q8C0T9 1614 aa40,25■■■■■ 4,03
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Abca6Q8K441 1624 aa40,25■■■■■ 4,03
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Hecw1Q8K4P8 1604 aa40,24■■■■■ 4,03
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP40,24■■■■■ 4,03
Tdp2-203ENSMUST00000223804 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa40,16■■■■■ 4,02
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa40,14■■■■■ 4,02
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ccnb3Q810T2 1396 aa40,13■■■■■ 4,02
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa40,13■■■■■ 4,01
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa40,13■■■■■ 4,01
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Map3k5O35099 1380 aa40,11■■■■■ 4,01
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Trpm1Q2TV84 1622 aa40,08■■■■■ 4,01
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa40,07■■■■■ 4
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Dip2aQ8BWT5 1523 aa40,06■■■■■ 4
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Nos1Q9Z0J4 1429 aa40,04■■■■■ 4
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Trpm2Q91YD4 1506 aa40,01■■■■■ 4
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Dip2bQ3UH60 1574 aa40,01■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Fhod3Q76LL6 1578 aa40,01■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Scn4aQ9ER60 1841 aa40■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Naip6Q9JIB6 1403 aa39,99■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Gli2Q0VGT2 1544 aa39,98■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Rsph4aQ8BYM7 716 aa39,96■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Pip4k2bQ80XI4 416 aa39,95■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Topaz1E5FYH1 1653 aa39,95■■■■□ 3,99
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Bcl9Q9D219 1425 aa39,91■■■■□ 3,98
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Prdm16A2A935 1275 aa39,88■■■■□ 3,97
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP39,85■■■■□ 3,97
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP39,82■■■■□ 3,97
Tdp2-203ENSMUST00000223804 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP39,82■■■■□ 3,96
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Kif3bQ61771 747 aa39,78■■■■□ 3,96
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Knl1Q66JQ7 1612 aa39,77■■■■□ 3,96
Tdp2-203ENSMUST00000223804 RictorQ6QI06 1708 aa39,74■■■■□ 3,95
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Gm13697A2AK42 830 aa39,72■■■■□ 3,95
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ncoa1P70365 1447 aa39,71■■■■□ 3,95
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Fmn2Q9JL04 1578 aa39,7■■■■□ 3,95
Tdp2-203ENSMUST00000223804 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP39,69■■■■□ 3,94
Tdp2-203ENSMUST00000223804 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa39,67■■■■□ 3,94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,4 ms