RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa28.95■■■□□ 2.22
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28.92■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cabp1Q9JLK7 227 aa28.9■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprtQ99M80 1454 aa28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 SphkapQ6NSW3 1687 aa28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Caskin1Q6P9K8 1431 aa28.88■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eid3Q3V124 375 aa28.88■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa28.87■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr7Q920I9 1489 aa28.86■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tdrd9Q14BI7 1383 aa28.85■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf17Q99MV7 1640 aa28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mtus2Q3UHD3 1353 aa28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca8bQ8K440 1620 aa28.83■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 TonslQ6NZL6 1363 aa28.83■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fhod3Q76LL6 1578 aa28.82■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa28.82■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccer2J3QPU5 274 aa28.81■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Il16O54824 1322 aa28.8■■■□□ 2.2
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf608Q56A10 1511 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp10dQ8K2X1 1416 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa28.77■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igf1rQ60751 1373 aa28.76■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep170Q6A065 1588 aa28.76■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa28.75■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pcgf6Q99NA9 353 aa28.73■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap5P97393 1501 aa28.73■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa28.72■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 AI481877A2ALV5 1481 aa28.7■■■□□ 2.19
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Trappc8E9PWG2 1437 aa28.66■■■□□ 2.18
Msx1-201ENSMUST00000063116 NclP09405 707 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cfap74Q3UY96 1578 aa28.64■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fmn2Q9JL04 1578 aa28.64■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 AlkP97793 1621 aa28.63■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setbp1Q9Z180 1582 aa28.63■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp644E9QA22 1323 aa28.62■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa28.61■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc3B2RX12 1523 aa28.6■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube2uB1AUC4 352 aa28.59■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.56■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mphosph9A6H5Y1 991 aa28.55■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kidins220E9Q9B7 1793 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfyve16Q80U44 1528 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28.53■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hecw1Q8K4P8 1604 aa28.53■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa28.51■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Neurl4Q5NCX5 1563 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm156Q58A37 223 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arid3cA6PWV5 409 aa28.46■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca9Q8K449 1623 aa28.46■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.44■■■□□ 2.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.4■■■□□ 2.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.39■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttll5Q8CHB8 1328 aa28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sall2Q9QX96 1004 aa28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Naip5Q9R016 1403 aa28.34■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pkd2O35245 966 aa28.33■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pprc1Q6NZN1 1644 aa28.31■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col17a1Q07563 1470 aa28.28■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr66E9Q743 1299 aa28.28■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Asxl1P59598 1514 aa28.27■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prdm16A2A935 1275 aa28.26■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa28.26■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca17E9PX95 1733 aa28.25■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k5O35099 1380 aa28.24■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3c2gO70167 1506 aa28.24■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map4P27546 1125 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp47Q8BY87 1376 aa28.21■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trak1Q6PD31 939 aa28.2■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Camsap2Q8C1B1 1461 aa28.19■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprgQ05909 1442 aa28.18■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 ClspnQ80YR7 1315 aa28.18■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lemd3Q9WU40 921 aa28.14■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.13■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 ShprhQ7TPQ3 1674 aa28.13■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 Depdc5P61460 1591 aa28.12■■■□□ 2.09
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