RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042125.14

Ttll4-201, Transcript of Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttll4, Length 10,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Pdcl3Q8BVF2 240 aa10.72□□□□□ -0.69
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Gpatch11Q3UFS4 262 aa10.72□□□□□ -0.69
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Irx6Q9ER75 438 aa10.71□□□□□ -0.69
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 ScribQ80U72 1612 aa10.7□□□□□ -0.7
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ccdc18Q640L5 1455 aa10.7□□□□□ -0.7
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Cluap1Q8R3P7 413 aa10.62□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Zscan21Q07231 555 aa10.62□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa10.61□□□□□ -0.71
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 NudcO35685 332 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Clstn1Q9EPL2 979 aa10.59□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Pkd2O35245 966 aa10.59□□□□□ -0.71
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Synj1Q8CHC4 1574 aa10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Sh3bp5Q9Z131 463 aa10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Stag3O70576 1240 aa10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Smarca2Q6DIC0 1577 aa10.58□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa10.58□□□□□ -0.72
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Gm20521D3Z5F7 333 aa10.57□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rock2P70336 1388 aa10.55□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Znf710Q3U288 666 aa10.55□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Golga2Q921M4 999 aa10.55□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ak7Q9D2H2 614 aa10.54□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ercc6F8VPZ5 1481 aa10.53□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rfx1P48377 963 aa10.53□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Tpm2P58774 284 aa10.53□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Samd1D3YXK1 519 aa10.52□□□□□ -0.72
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Plekhh2Q8C115 1491 aa10.52□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Usp47Q8BY87 1376 aa10.52□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Tmco5bQ80X59 307 aa10.52□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Fam13bQ8K2H3 851 aa10.52□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ecm2Q5FW85 670 aa10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Plppr3Q7TPB0 716 aa10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Cspp1B2RX88 1205 aa10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Taf3Q5HZG4 932 aa10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Tomm22Q9CPQ3 142 aa10.51□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Mphosph9A6H5Y1 991 aa10.5□□□□□ -0.73
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Pnmal2G3X9N3 661 aa10.5□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Iqcf3Q9D498 203 aa10.49□□□□□ -0.73
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Iffo2Q8R2V2 512 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ubl4bQ9CQ84 188 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Stk24Q99KH8 431 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ubap1lG3UW59 384 aa10.48□□□□□ -0.73
Ttll4-201ENSMUST00000042125 TimelessQ9R1X4 1197 aa10.47□□□□□ -0.73
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 R3hcc1Q8BSI6 488 aa10.47□□□□□ -0.73
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