RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022469.12

Nisch-201, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene Nisch, Length 5,559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-201ENSMUST00000022469 Adam1bQ8R534 806 aa27.07■■□□□ 1.92
Nisch-201ENSMUST00000022469 CntlnA2AM05 1397 aa27.06■■□□□ 1.92
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tmf1B9EKI3 1091 aa27.04■■□□□ 1.92
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cnga1P29974 684 aa27.03■■□□□ 1.92
Nisch-201ENSMUST00000022469 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26.99■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Zfp777B9EKF4 885 aa26.99■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 MccE9PWI3 1003 aa26.96■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Erich6bQ9D4S6 220 aa26.95■■□□□ 1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cabp1Q9JLK7 227 aa26.95■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Trak1Q6PD31 939 aa26.94■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa26.93■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa26.93■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa26.89■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.87■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Golga2Q921M4 999 aa26.87■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.87■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 PnnO35691 725 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 CftrP26361 1476 aa26.84■■□□□ 1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tnnt2P50752 301 aa26.82■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rock2P70336 1388 aa26.82■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rpap1Q80TE0 1409 aa26.79■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 ChgaP26339 463 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 CrbnQ8C7D2 445 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-201ENSMUST00000022469 NgefQ8CHT1 710 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cluap1Q8R3P7 413 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 MsnP26041 577 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Plekhh2Q8C115 1491 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Znf326O88291 580 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tmco5bQ80X59 307 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 UacaQ8CGB3 1411 aa26.7■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa26.7■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Carmil1Q6EDY6 1374 aa26.7■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm973E9Q295 1059 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pcmtd1P59913 357 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Srcin1Q9QWI6 1250 aa26.67■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.66■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Usp47Q8BY87 1376 aa26.64■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sh3bp5Q9Z131 463 aa26.63■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ccnb3Q810T2 1396 aa26.63■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.62■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Znf330Q922H9 316 aa26.62■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pde3bQ61409 1100 aa26.61■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ksr2Q3UVC0 959 aa26.6■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ddrgk1Q80WW9 315 aa26.6■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Slc4a1apE9PX68 744 aa26.6■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mre11Q61216 706 aa26.58■■□□□ 1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stk26Q99JT2 416 aa26.57■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 GorabQ8BRM2 368 aa26.57■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 SlkO54988 1233 aa26.55■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Calcoco2A2A6M5 331 aa26.55■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stard8Q8K031 1019 aa26.52■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pank3Q8R2W9 370 aa26.52■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rassf8Q8CJ96 419 aa26.52■■□□□ 1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Plin1Q8CGN5 517 aa26.51■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rock1P70335 1354 aa26.5■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.49■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rsph3aQ3UFY4 516 aa26.48■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cux2P70298 1426 aa26.48■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa26.47■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Birc3O08863 600 aa26.47■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 RdxP26043 583 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 CgnP59242 1191 aa26.47■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Iffo2Q8R2V2 512 aa26.46■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Q3TQI7 289 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 AknaQ80VW7 1404 aa26.45■■□□□ 1.83
Nisch-201ENSMUST00000022469 Atp6v1dP57746 247 aa26.45■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 VgfQ0VGU4 617 aa26.45■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Becn1O88597 448 aa26.45■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lemd3Q9WU40 921 aa26.44■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cgnl1Q6AW69 1298 aa26.43■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Clstn1Q9EPL2 979 aa26.43■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 R3hcc1Q8BSI6 488 aa26.43■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ecm2Q5FW85 670 aa26.42■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Inpp5dQ9ES52 1191 aa26.4■■□□□ 1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Anapc15P60007 132 aa26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.6 ms