RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	ECM27	P47144	725 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	EFM3	P47163	339 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MUP1	P50276	574 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LSB1	P53281	241 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	GSH2	Q08220	491 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SNT2	P53127	1403 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MET3	P08536	511 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SPS4	P09937	338 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PET123	P17558	318 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SPE2	P21182	396 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LAC1	P28496	418 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
CIN1	YOR349W	GIP4	P39732	760 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SMA1	Q02651	245 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	HPF1	Q05164	967 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TGS1	Q12052	315 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DFG16	Q99234	619 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	BOS1	P25385	244 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RAD51	P25454	400 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CDC20	P26309	610 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	BUD17	P53727	317 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SNO2	P53823	222 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	UBP16	Q02863	499 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YMR187C	Q03236	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MTR10	Q99189	972 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TRM732	Q03496	1420 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VPS63	O13549	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CDC6	P09119	513 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RAD14	P28519	371 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PLB1	P39105	664 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ELO1	P39540	310 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ECM10	P39987	644 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YFL066C	P43538	392 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	UBC11	P52492	156 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DLT1	Q04216	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TAP42	Q04372	366 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CRT10	Q08226	957 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VAM3	Q12241	283 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DMC1	P25453	334 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PHO11	P35842	467 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	GLG1	P36143	616 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PHO12	P38693	467 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	LAS21	P40367	830 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	VHS2	P40463	436 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	NMD5	P46970	1048 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YIP4	P53093	235 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ORC3	P54790	616 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YML053C	Q04978	212 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	AMD2	P22580	549 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RDS1	P25611	832 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YBR053C	P38235	358 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YIP5	P53108	310 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	DIP5	P53388	608 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	TDA6	Q06466	467 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ATG9	Q12142	997 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MER1	P16523	270 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	PET18	P25362	215 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	HIR2	P32480	875 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	NUP133	P36161	1157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MRPL37	P36532	105 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	APL3	P38065	1025 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CIN1	YOR349W	MSG5	P38590	489 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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