RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PDE1	P22434	369 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	ADH7	P25377	361 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YKR015C	P36111	568 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	TAE1	P38340	232 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	TCD1	P38756	429 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	BRO1	P48582	844 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SCW11	P53189	542 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PGA2	P53903	129 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	RSM24	Q03976	319 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DCS1	Q06151	350 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	CRT10	Q08226	957 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YOL107W	Q12239	342 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SWM1	Q12379	170 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YPR089W	O13585	888 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SDH8	P38345	138 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	VAC14	Q06708	880 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MED2	Q12124	431 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MTR10	Q99189	972 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	GPA1	P08539	472 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	BCS1	P32839	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SLX1	P38324	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SWC5	P38326	303 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PET100	P38958	111 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YER085C	P40058	173 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MRK1	P50873	501 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	COQ6	P53318	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	OCA2	P53949	197 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PET117	Q02771	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MFM1	Q02783	413 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	EKI1	Q03764	534 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	ARG7	Q04728	441 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	ATG9	Q12142	997 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MED4	Q12343	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DAL81	P21657	970 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	HIR2	P32480	875 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	MRPL7	P36519	292 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DIA3	P52290	468 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	DSL1	P53847	754 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	STD1	Q02794	444 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	SRL4	Q03085	281 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	VAM3	Q12241	283 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG7	YHR171W	PCT1	P13259	424 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	CHS2	P14180	963 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	MSR1	P38714	643 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	MSY1	P48527	492 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	YGR126W	P53274	230 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	NRG1	Q03125	231 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RSN1	Q03516	953 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	COQ9	Q05779	260 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RRG8	Q06109	277 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	TPO1	Q07824	586 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	YHR045W	P38775	560 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RPP1	P38786	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	FAR3	P46671	204 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	AIM22	P47051	409 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	GAS5	Q08193	484 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	COX3	P00420	269 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	PDE2	P06776	526 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	IMG1	P25626	169 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATG7	YHR171W	GSH1	P32477	678 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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