RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A CTI6Q08923 506 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SET6Q12529 373 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RAD52P06778 471 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data2.37□□□□□ -2.03not detected
RPC10YHR143W-A RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A EXO70P19658 623 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A OLE1P21147 510 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GFD2P25370 566 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A UTR4P32626 227 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A FRE1P32791 686 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A REG2P38232 338 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YHR218WP38899 603 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RPR2P40571 144 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AIM22P47051 409 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SLD5Q03406 294 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A VPS74Q06385 345 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SYO1Q07395 620 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A THP1Q08231 455 aa2.37□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SUC2P00724 532 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GCN4P03069 281 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ATR1P13090 542 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A CBS1P14066 229 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PRD1P25375 712 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BNA4P38169 460 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MUM2P38236 366 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MSR1P38714 643 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A KRE9P39005 276 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A NPR2P39923 615 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ALG8P40351 577 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MRX6P48564 524 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GPI1P53306 609 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
RPC10YHR143W-A RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A COQ9Q05779 260 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A VPS38Q05919 439 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RLM1Q12224 676 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AYT1Q12226 474 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AVL9Q12500 764 aa2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A CBS2P14905 389 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A OCA4P25366 362 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PEP3P27801 918 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AGA1P32323 725 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IMP2'P32351 346 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PMU1P36069 295 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TUL1P36096 758 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A DUG2P38149 878 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SHO1P40073 367 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ELP2P42935 788 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A VPS75P53853 264 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IRC15Q02733 499 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TLG2Q08144 397 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RAV1P47104 1357 aa2.35□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A HEM2P05373 342 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ELO2P25358 347 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ATS1P31386 333 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YME1P32795 747 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MSN2P33748 704 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A WBP1P33767 430 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AVT5P38176 459 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ERP2P39704 215 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RMD8P43620 662 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BOR1P53838 576 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PHO92Q06390 306 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YDL121CQ07541 149 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YLL056CQ12177 298 aa2.34□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A GAL80P04387 435 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A COR1P07256 457 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MRE11P32829 692 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YBR139WP38109 508 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SRO77P38163 1010 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A HAT2P39984 401 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.33□□□□□ -2.04not detected
RPC10YHR143W-A MET28P40573 187 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A IDP2P41939 412 aa2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms