RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	THI73	Q07904	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DIT2	P21595	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	UGA2	P38067	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CSM2	P40465	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HCH1	P53834	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	VHS1	Q03785	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RKM2	Q03942	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	LIP2	Q06005	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GMC2	Q06201	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	THI21	Q08975	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TAF10	Q12030	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPT7	P32939	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RRN10	P38204	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ORC6	P38826	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RRT14	P40470	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YJL016W	P47072	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	COG5	P53951	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CRD1	Q07560	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FLC1	Q08967	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRM1	P25270	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SUL1	P38359	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SHU2	P38957	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NTA1	P40354	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HAP5	Q02516	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YET2	Q04210	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ALE1	Q08548	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RAD24	P32641	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	REC114	P32841	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SPT10	P35208	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YET1	P35723	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TPO5	P36029	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	VID24	P38263	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CKB2	P38930	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YSA1	Q01976	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ANB1	P19211	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SLY1	P22213	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRX5	P47007	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HXT15	P54854	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FMP30	Q02883	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	UNG1	P12887	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	IDI1	P15496	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NPR1	P22211	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YCR051W	P25631	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	APL3	P38065	1025 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MNN2	P38069	597 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	IMA5	P40884	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DSE3	Q08729	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MCM16	Q12262	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPT6	Q99260	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	URK1	P27515	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RFC5	P38251	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CUE1	P38428	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PTC7	P38797	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PHM8	P40025	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRM2	P53123	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PRM1	P53835	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	STE6	P12866	1290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ARG1	P22768	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SIP1	P32578	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.5 ms