RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W TGL2P54857 326 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PRO2P54885 456 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SDH1Q00711 640 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ECM9Q02202 377 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YIG1Q08956 461 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TRM8Q12009 286 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W VPS68Q12016 184 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MET32Q12041 191 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W NAG1Q8TGN9 163 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ATP2P00830 511 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HXK2P04807 486 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W STE3P06783 470 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SAN1P22470 610 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MEF1P25039 761 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RML2P32611 393 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W STT4P37297 1900 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MED8P38304 223 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YEL073CP39974 107 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W LSM5P40089 93 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YFR018CP43599 363 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YGL176CP46945 554 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MPS2P53159 387 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YGR015CP53208 328 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YGR053CP53234 283 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W BIO5P53744 561 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SMA1Q02651 245 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YDR476CQ03362 224 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W GRS2Q06817 618 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YPR097WQ06839 1073 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SAS5Q99314 248 aa8.67□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ATP6P00854 259 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RSR1P13856 272 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PHO81P17442 1178 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CCR4P31384 837 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COX13P32799 129 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data8.66□□□□□ -1.02not detected
DDI1YER143W WSC4P38739 605 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HPM1P40481 377 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SNO2P53823 222 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W VHS1Q03785 461 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YDR124WQ04608 324 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ARG7Q04728 441 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W OPI10Q08202 246 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HUA2Q12134 243 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa8.66□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PHO87P25360 923 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W EMC3P36039 253 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W GIP4P39732 760 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W JEM1P40358 645 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MAM33P40513 266 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PFA3P42836 336 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YFR020WP43600 232 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COQ5P49017 307 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YNR014WP53719 212 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ARC35P53731 342 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CWC24P53769 259 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MPS1P54199 764 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YPL113CQ02961 396 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ROT1Q03691 256 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ACL4Q03771 387 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W UAF30Q08747 228 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W JLP1Q12358 412 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MHT1Q12525 324 aa8.65□□□□□ -1.02
DDI1YER143W REC107P21651 314 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GIP1P38229 639 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HXT5P38695 592 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PPX1P38698 397 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ARB1P40024 610 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W BIR1P47134 954 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YJR149WP47177 404 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W FAA4P47912 694 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GCV1P48015 400 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PLB3Q08108 686 aa8.64□□□□□ -1.03
DDI1YER143W AI3P03877 415 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W DST1P07273 309 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PDC5P16467 563 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ZIP1P31111 875 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YPT35P38815 214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W NUP85P46673 744 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SUM1P46676 1062 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YJR030CP47101 745 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MDM34P53083 459 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ECM11Q04110 302 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W DYN3Q04949 312 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GGA1Q06336 557 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W BCP1Q06338 283 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ASA1Q06822 443 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PSR1Q07800 427 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SGT1Q08446 395 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SRO7Q12038 1033 aa8.63□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YVC1Q12324 675 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms