RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W UBS1P38290 277 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W POP4P38336 279 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SPC97P38863 823 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W FMP10P40098 244 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YTA12P40341 825 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W JEM1P40358 645 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PFK26P40433 827 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ASG1P40467 964 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W HOP2P53187 214 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YGR111WP53265 400 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ARO80Q04052 950 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PPM1Q04081 328 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YMR027WQ04371 470 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YDR222WQ04925 415 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data5.51□□□□□ -1.53not detected
VHS1YDR247W PCL8Q08966 492 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W HUA2Q12134 243 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ACF2Q12168 779 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W VCX1Q99385 411 aa5.51□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RPC19P28000 142 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SIP1P32578 815 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W COY1P34237 679 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ECM4P36156 370 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YPT10P38146 199 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W UBP7P40453 1071 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W GPD2P41911 440 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W FMS1P50264 508 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W USE1P53146 245 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W IMO32P53219 342 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YGR079WP53249 370 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ARK1P53974 638 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YSA1Q01976 231 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MUK1Q02866 612 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W DON1Q05610 365 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RRD2Q12461 358 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ARP6Q12509 438 aa5.5□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W TYR1P20049 452 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SGF29P25554 259 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MGT1P26188 188 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PEX2P32800 271 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MTG2P38860 518 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W LAS21P40367 830 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W DUO1P53168 247 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SUN4P53616 420 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W TIM44Q01852 431 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ACL4Q03771 387 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W CUR1Q06469 252 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ENT4Q07872 247 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RUP1Q12242 671 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ZPS1Q12512 249 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa5.49□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SEC53P07283 254 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YML003WP0CF16 290 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W WHI2P12611 486 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PMS1P14242 873 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W AST1P35183 429 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ALY1P36117 915 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W GEX2P36173 615 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W DUG2P38149 878 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YBL029WP38201 376 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W CST26P38226 397 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PFF1P38244 976 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W IRC24P40580 263 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W GCN20P43535 752 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W FMP33P46998 180 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W LIA1P47120 325 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W AAD10P47182 288 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MSE1P48525 536 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W COQ6P53318 479 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MRPL19P53875 158 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YNL092WP53934 400 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W TIM10P87108 93 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W OSH6Q02201 448 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RPM2Q02773 1202 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W FMN1Q03778 218 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W INP2Q03824 705 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ERV41Q04651 352 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YLR053CQ12026 108 aa5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RAD10P06838 210 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YAK1P14680 807 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W EXO70P19658 623 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W OLE1P21147 510 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W AMD2P22580 549 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W DAL2P25335 343 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W PGS1P25578 521 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W AAD3P25612 363 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YSC83P32792 385 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SEC66P33754 206 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W HES1P35843 434 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W LHS1P36016 881 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RPF2P36160 344 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YBR225WP38321 900 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SMF2P38778 549 aa5.47□□□□□ -1.53
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