RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 SDF4Q9BRK5 362 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 AMNQ9BXJ7 453 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 VWA5AO00534 786 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SLC10A3P09131 477 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 30.7
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CLN8-208ENST00000635751 USH1GQ495M9 461 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZBED4O75132 1171 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CMA1P23946 247 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 JMYQ8N9B5 988 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SARM1Q6SZW1 724 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CPXCR1Q8N123 301 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZNF536O15090 1300 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 MYPNQ86TC9 1320 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 BTBD19C9JJ37 291 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PPP6R2O75170 966 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 FDX1P10109 184 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CDC25BP30305 580 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 APLP1P51693 650 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CCDC102AQ96A19 550 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.66■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 SMCO2A6NFE2 343 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS3O15072 1205 aa22.66■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 NPY5RQ15761 445 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 DRC7Q8IY82 874 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 OXER1Q8TDS5 423 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PTPN18Q99952 460 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 BTBD18B2RXH4 712 aa22.65■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 GRM1Q13255 1194 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 REPS2Q8NFH8 660 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.65■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 BECN2A8MW95 431 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PDHXO00330 501 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZNF202O95125 648 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 PFKFB1P16118 471 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.64■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-208ENST00000635751 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.64■■□□□ 1.22
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CLN8-208ENST00000635751 HERVK_113P62684 666 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 NR5A1Q13285 461 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PTPAQ15257 358 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 C6orf50Q9HD87 102 aa22.64■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 PTGS1P23219 599 aa22.63■■□□□ 1.21
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CLN8-208ENST00000635751 TIGD1Q96MW7 591 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 ESYT2A0FGR8 921 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PEX10O60683 326 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 GNA11P29992 359 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 TRAF1Q13077 416 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 LBX2Q6XYB7 198 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-208ENST00000635751 PNMA3Q9UL41 463 aa22.62■■□□□ 1.21
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