RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PORCN	Q9H237	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GBF1	Q92538	1859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GTH6	734 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CIAO1	O76071	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RHOQ	P17081	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNA1	Q09470	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	OCLN	Q16625	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRC	P08575	1304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GUL7	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CNMD	O75829	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CAP2	P40123	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TIMM10	P62072	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HERVK_113	P62684	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TFCP2	Q12800	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HIF1A	Q16665	826 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	USP6NL	Q92738	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MEIS3	Q99687	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	EML1	O00423	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MCAM	P43121	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	BACE1	P56817	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ERVK-24	P63145	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FLT1	P17948	1338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TRANK1	O15050	2925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	F11	P03951	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CAPN2	P17655	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MSX1	P28360	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2C19	P33261	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PTS	Q03393	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63

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